古代人民对水稻病害有一定认识，从实践中也摸索积累了各种有效的防治措施。一般从栽培措施、药剂防治和生物防治3方面着手。
在栽培措施方面，一是实行轮作，这是最简单有效的减少病虫的办法。早在《齐民要术》种水稻篇中即指出：种稻没有什么诀窍，只要年年轮换田块就好了。
二是烤田防虫，烤田就是在水稻分蘖末期，为控制无效分蘖期并改善稻田土壤通气和温度条件，排干田面水层进行晒田的过程。这样土壤水分减少，促使植物根向土壤深处生长，有利于植物生长发育。
从防虫角度讲，烤田使水分供应减少，地上部的生长受到抑制，改变了稻株光合作用产物运转的方向，即向茎和叶鞘内集中，增加半纤维素的含量，不利于害虫的繁殖。
三是选用抗性品种。比如种植多芒的品种防止鸟兽为害。明末江苏《太仓州方志》中载有一个绿芒品种，名“哽杀蟛蜞”，虽无文字说明，从取名上可知是一个适于涂田种植不怕虫鸟啮食的抗避品种。
药物防治一是烟茎治螟。烟草在明代传入我国南方，以后很快传遍各地。农民在种植烟草中，发现烟茎及叶有杀虫的作用，因而试用于稻螟，效果很好，于是不胫而走，推广得很快。
二是菜油治虫。用菜油治虫始见于宋代。1180年8月，苏州闹虫灾，虫聚于禾穗上，当地农民以菜油洒之，一夕大雨，尽除之。到清末民初，农民遂用石油代菜油治虫，直至现代农药出现为止。
三是石灰治虫。以石灰作为治虫的药物也始见于宋代。南宋陈旉《农书》提到在播种前“搬石灰于渥泥之中，以去虫螟之害”。是石灰治虫的最早记载。
生物防治在我国有久远历史。水稻害虫的天敌，古人加以利用的
有数种。一是青蛙。稻田养蛙以消除虫害，是被古人运用了很久的办法。二是养鸭治虫。利用放鸭到稻田治虫始见于明代广东、福建两
省。据说以鸭捕蝗与人力捕蝗比较“一鸭较胜一夫”，“四十只鸭，可治四万之蝗”。三是保护益鸟。历史上蝗灾频繁，古人早已观察到有一些鸟类扑食蝗虫的现象，于是对益鸟进行保护。历朝历代不乏政府提倡保护益鸟的例子。