大气污染物有硫化物、氟化物、氯化物、氮氧化物、粉尘和带有金属元素的气体等。大气污染物危害玉米主要有3种方式：直接可见伤害，叶片表面呈现特征性症状；对生长发育和产量产生影响；对玉米品质产生影响。
（1）二氧化硫的危害二氧化硫（SO2）主要来自植物燃烧和冶炼厂排放。在干燥的空气中较稳定，但在湿度大的空气中，SO2经催化或光化学反应，可转化为亚硫酸根离子SO2-3，SO2-3又可逐渐氧化成硫酸根离子SO2-4，进而生成硫酸雾或硫酸盐，形成含有硫酸、硫酸铵等物质的气溶胶，随雨而降，即为酸雨。SO2-3的毒性比SO2-4大30倍，当SO2-3离子不断增加，超过玉米自净能力时，就会导致叶细胞破坏，叶片水分减少，糖和氨基酸下降，最终使产量下降，品质变劣。（2）氟化物的危害大气氟化物污染可分为两类，一是生活燃煤污染，二是化工厂（磷肥制造等）、铝厂、钢铁厂排放的氟气、氟化氢、四氟化硅和含氟粉尘。氟化物中以氟化氢的毒性最大。玉米是对氟化氢最敏感的作物，在氟化氢浓度极低时，接触3天，植株就受到伤害。通过气孔进入植物体内，氟化物能取代酶蛋白中的金属元素，使酶失去活性，影响玉米的生理生化过程。
氟在人体内积累所引起的最典型的疾病是氟斑牙（褐色斑釉齿）和氟骨症（骨骼变形、骨质疏松、关节肿痛）。（3）氮氧化物的危害氮氧化物种类较多，造成大气污染的主要物质是一氧化氮（NO）、二氧化氮（NO2）以及氧化二氮（N2O）。这些氮氧化物进入大气之后，则可转化成含NH+4、NO-3的气溶胶，这类气溶胶随着降水，落入土壤和水体。（4）臭氧的危害玉米对臭氧较为敏感，受到伤害后，在植株低叶位出现水泡，气孔附近的表皮细胞和叶肉中的海绵组织细胞发生萎缩，叶面出现水渍斑纹，最后叶肉细胞脱水死亡。同时由于细胞间隙较大，叶片下面开始呈现银白色、棕色或古铜色。在玉米成熟的中位叶上，沿叶脉出现斑点，形成缩状。（5）煤烟粉尘和金属飘尘的危害煤烟粉尘产生于冶炼厂、钢铁厂、焦化厂、供热锅炉以及家家户户取暖烧饭的烟囱。因燃烧条件和燃烧程度不同，所产生的烟尘数量也各不一样。一般每吨煤大约产生4～28千克烟尘。这些烟尘的粒径极小，大约在0.05～10微米之间。以粉尘污染源为中心，周围几十公顷的耕地和下风向几公里区域内的玉米都会受到影响。
金属飘尘来源于矿区和冶炼厂。飘尘中可能含有粒径小于10微米的铅、镉、铬、锌、镍、砷、汞等有毒有害微粒。这些微粒可能长时间随风飘浮在空中，也可能随着雨雪下降到地面，然后又在玉米中积累，进入食物链，给人、畜带来危害。（6）无公害玉米生产对空气质量的要求《环境空气质量标准》（GB3095—1996）将环境空气质量按功能区分为3类：一类区为自然保护区、风景名胜区和其他需要特殊保护的地区；二类区为城镇规划中确定的居住区、商业交通居民混合区、文化区、一般工业区和农村地区；三类区为特定工业区。该标准共分三级：一类区执行一级标准，二类区执行二级标准，三类区执行三级标准。玉米属于二类区，执行二级标准。现将二级环境空气质量标准摘录如下（表5）。
表5 各项污染物的浓度限值污染物名称 取值时间年平均 季平均 月平均 日平均 1小时平均 生长季节平均 浓度单位二氧化硫（SO2）0.06 0.15 0.50总悬浮颗粒物（TSP）0.20 0.30可吸入颗粒物（PM10）0.10 0.15氮氧化物（NOX）0.05 0.10 0.15二氧化氮（NO2）0.04 0.08 0.12一氧化碳（CO）4.00 10.00臭氧（O3）0.16毫克/米3（标准状态）铅（Pb）1.00 1.50苯并［a］芘B［a］P 0.01 微克/米3（标准状态）氟化物（F）3.0 2.0 微克/（分米2?天）