济宁市博物馆新馆位于太白湖新区市文化中心，由世界著名建筑设计大师马里奥·博塔主持设计，整体建筑形体舒展，比例亲切宜人，设计理念简洁明快、实用经济、安全合理，不仅具有博物馆建筑性格特点、突显地域历史文化内涵，更富有时代性，追求变化而丰富的室内空间效果。通过室内外空间的设计，充分利用阳光，达到“人与自然”合一的空间氛围，让人印象深刻，使整个博物馆成为一件艺术作品，在历史的长河中沉淀而成为经典。馆内设计有中国运河之都——济宁、石刻艺术展厅、济宁千秋展、数字博物馆等。
博物馆功能齐全，包括七大功能区，分别为：陈列展览区、文物库房区、教育交流区、技术研究区、行政办公区、访客服务区、设备用房等，是济宁市收藏、保护、展示、研究文物及文化资源的综合博物馆建筑，同时也是进行教育、休闲、文化服务活动的场所。