福建农业职业技术学院是一所以农业为主导，工、商、文、理、教育等多学科协调发展的全日制普通高等职业院校。学院设有14个二级学院，开设了52个专业（方向），涵盖了农、林、牧、渔、食品、机电、建筑、电子信息、经济管理、文化传媒等多个领域。
在众多专业中，有几个专业实力较强：
1.园艺技术：该专业培养具备园艺植物生产、管理和科研能力的高级技术应用型人才。学生主要学习园艺植物栽培、育种、病虫害防治、设施园艺等方面的基本理论和基本技能。毕业生就业前景广阔，可以在农业部门、园林公司、农业科研机构等领域从事相关工作。
2.动物医学：该专业培养具备动物疾病诊断、治疗和预防能力的高级技术应用型人才。学生主要学习动物解剖学、生理学、病理学、药理学等方面的基本理论和基本技能。毕业生就业前景较好，可以在兽医站、养殖场、宠物医院等领域从事相关工作。
3.食品科学与工程：该专业培养具备食品加工、质量管理和研发能力的高级技术应用型人才。学生主要学习食品化学、食品微生物学、食品工程原理等方面的基本理论和基本技能。毕业生就业前景较好，可以在食品企业、检验检疫部门、科研院所等领域从事相关工作。