都可以，都有优点。
1、晨跑优点：使一整天精神饱满：缺点：加大心脑血管负担、空气质量令人担忧：不少人认为早上起来运动有助提高新陈代谢，让人一整天都精力充沛，精神饱满。
坚持晨跑可以增强体质、提高免疫力、改善精神状态。晨跑应注意以慢跑为主，并且晨跑之前应补充足够的水分和少量的食物。不过，身体就像是机器，运作之前需要预热，预热不充分会导致零件磨损。早上锻炼会加大心脑血管的负担，热身不充分，甚至有关节受伤的危险。
2、夜跑优点：减肥效果佳：缺点：易受风寒入侵；夜跑似乎是学生、白领等白天难以抽空锻炼的人群最好的选择。出汗少，凉快，不会晒黑，而且荷尔蒙在此时间段对锻炼的反应最强烈，有较好的减肥效果。
夜跑通常是21时左右，运动的时间最好是在30分钟至60分钟。夜跑，是最简单的一种锻炼方式，只要你有一双合适的鞋子，就可以跑起来。傍晚或者夜幕降临之时，出来跑步，白天工作上的困扰也能通过夜跑获得精神上的放松而迎刃而解。
并非人人适用的最佳跑步时间
从运动医学角度来说，人体身体温度最高的时间就是最佳的运动时间，而下午就是体温最高时段，这时候人体的生理机能和精神状态开始趋于最佳，耐力和灵活性不断提高。
而到了下午4点--6点间，人体的体温会达到最高值，也即迎来了人体运动的最佳时间，这也是为什么众多顶级体育比赛都选择在这一时间进行的原因。如果条件允许，可以选择在这期间进行间歇跑等高强度的训练。
但是，这个人体机能的最佳的跑步时间，还是有一些局限，因为除了专业运动员外，普通跑者大都在这时候忙于工作或学习，恐怕没有多少人能有条件长期坚持做运动。
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