合同上手写补充经双方确认有效，未经双方对补充部分签字盖章的手写内容不发生效力。且应当是双方的合同上都有相同条款才行，因为在实践中就发生过一方持有的合同上有手写条款，而另一方持有的合同上没有相应条款时，被法院认定该条款不成立的情况。
补充协议是对原合同的补充或者变更，一般要明确约定，如果补充协议条款与原合同不一致或发生冲突时，应当以补充协议为准，但原合同明示不得变更的条款，补充协议中对该条款发生的变更则不发生法律效力。
当事人订立合同，有书面形式、口头形式和其他形式。法律、行政法规规定采用书面形式的，应当采用书面形式。当事人约定采用书面形式的，应当采用书面形式。
依法成立的合同受法律保护，合同生效后当事人必须按照合同的约定全面履行约定的义务，非经协商一致不得擅自补充变更解除合同，不得随意增设额外义务。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》
第五百零九条 当事人应当按照约定全面履行自己的义务。当事人应当遵循诚信原则，根据合同的性质、目的和交易习惯履行通知、协助、保密等义务。当事人在履行合同过程中，应当避免浪费资源、污染环境和破坏生态。
第五百一十条 合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同相关条款或者交易习惯确定。
第五百四十三条 当事人协商一致，可以变更合同。
第五百四十四条 当事人对合同变更的内容约定不明确的，推定为未变更。
第一百四十三条 具备下列条件的民事法律行为有效
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
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