方孝孺被灭十族的真相是其惹恼了当初靖难成功的燕王朱棣。
方孝儒是宋濂的学生，在朱元璋时期曾经受到召见，朱元璋也很欣赏他的才华，但是两人治国理念不同，所以朱元璋将其留给了自己的孙子朱允炆，让其帮助朱允炆治理朝政，更是成为了朱允炆的老师，朱允炆登基之后因为削藩引起燕王朱棣发起靖难之役，攻陷南京，朱允炆下落不明，很多大臣都投靠了燕王朱棣。
方孝儒对朱允炆忠心耿耿，誓死不投降朱棣，而且骂朱棣是乱臣贼子，由于朱棣刚刚占领南京，为了安抚人心就一直忍耐方孝儒，但是方孝儒对此并不领情，甚至每日穿着孝服上朝，在方孝儒写下“燕贼篡位”的诏书后，朱棣盛怒之下将其凌迟处死，并下令诛灭方孝孺十族。
方孝孺简介
方孝孺（1357年-1402年7月25日），字希直，又字希古，号逊志，因其故里旧属缑城里，故称“缑城先生”；又因在汉中府任教授时，蜀献王赐名其读书处为“正学”，亦称“正学先生”，浙江宁海人。明朝大臣、学者、思想家。
方孝孺自幼聪明好学，长大后拜名儒宋濂为师，深受器重。1398年，惠帝即位后，遵先皇遗训，召方孝孺入京委以重任，先后让其出任翰林侍讲及翰林学士。次年，值文渊阁，尊以师礼，皇帝读书每遇到疑难问题，均宣其御前讲解。凡有国家大事，也命其坐前批答。此时宫中纂修《太祖实录》及《类要》，由方孝孺任副总裁。
其后又调任文学博士，奉命与董伦、高逊志等主持京考。燕王朱棣誓师“靖难”，挥军南下京师。皇帝派兵北伐，当时讨伐燕王的诏书檄文多出自方孝孺之手。1402年五月，燕王攻占南京，文武百官见风转舵者居多，唯独方孝孺拒不投降，被下狱后凌迟处死，时年四十六岁。
以上内容参考：百度百科-方孝孺
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