1、身份不相同
一般而言，国家公务员都是行政编制。享受国家的各种法定待遇。事业编是事业单位编制的简称，一般都是事业单位，一般医院、学校、一些政厅就是典型的事业单位。无论是行政编还是事业编都是需要考试进入。
2、级别不相同
在行政编制就是国家公务员，是有级别的。而事业编制，名义上是国家干部，实际上还是工人身份，评定的是职称。
3、退休后待遇不相同
公务员不用交养老金，所以退休后差别还是比较大的，如果是你是事业单位的，那你每个月发的工资中，会扣除养老金。而公务员不用扣。
4、机构性质不相同
事业单位一般是国家设置的带有一定的公益性质的机构，但不属于政府机构，与公务员是不同的。一般情况下国家会对这些事业单位予以财政补助。事业单位不属于政府机构，一般情况下国家会对这些事业单位予以财政补助，分为全额拨款事业单位(信访局)、差额拨款事业单位(交通局)，还有一种是自主事业单位(医院)，是国家不拨款的事业单位。
事业编制可分为全额编制、差额事业编制和自筹自支事业编制三种，全额事业编又叫全额全额财政拨款事业编制，参照公务员管理，基本待遇与公务员一致，多为一些公益性事业单位和部分具有行政执法只能的事业单位，如城管、学校、农技站等。差额事业编制，由财政进行差额拨款，待遇和收入在一定程度上挂钩，如医院和部分景点等。自筹自支事业编制，实际上与企业差不多，待遇和经营状况息息相关，多为一些服务型事业单位，如宾馆、培训中心、设计室等。
法律依据：
《中华人民共和国公务员法》
第十五条 公务员享有下列权利：
（一）获得履行职责应当具有的工作条件；
（二）非因法定事由、非经法定程序，不被免职、降职、辞退或者处分；
（三）获得工资报酬，享受福利、保险待遇；
（四）参加培训；
（五）对机关工作和领导人员提出批评和建议；
（六）提出申诉和控告；
（七）申请辞职；
（八）法律规定的其他权利。
第三章 职务、职级与级别
第十六条 国家实行公务员职位分类制度。
公务员职位类别按照公务员职位的性质、特点和管理需要，划分为综合管理类、专业技术类和行政执法类等类别。根据本法，对于具有职位特殊性，需要单独管理的，可以增设其他职位类别。各职位类别的适用范围由国家另行规定。
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