一般原因可以从两个方面找：
1、确认证件号码位置是否找对了，通行证的号码在港澳通行证有相片的那一页右上角红色字体英文W开头后面8位数字。
2、号码确认正确的话，如果有身份信息变更问题，港澳通行证第一次续签得去发证的那个网点才能办理的，否则都会显示无效的号码。之后就可以自由的网上续签了。
港澳通行证，俗称双程证，是由中华人民共和国公安部出入境管理局签发给中国内地居民因私往来香港或澳门地区旅游、探亲、从事商务、培训、就业、留学等非公务活动的旅行证件。
2018年9月1日起，内地居民可在全国范围内任一公安出入境管理机构异地申请换（补）发普通护照、往来港澳通行证、往来台湾通行证；可在全国范围内任一公安出入境管理机构异地申请往来港澳台团队旅游签注。
扩展资料：
证件有效期
往来港澳通行证有效期5年。2014年9月15日，全面启用电子往来港澳通行证规定，成年人电子往来港澳通行证有效期延长为10年，对未满16周岁的仍签发5年有效通行证。
签注有效期
内地居民往来港澳签注分为6个种类，即个人旅游（G）、探亲（T）、商务（S）、团队旅游（L）、其他（Q）、逗留（D）根据申请事由分类签发。
其中香港G签和L签的有效期都为：3个月1次、3个月2次、1年1次、1年2次四种有效签注。澳门签注只有3个月1次、1年1次申请。签注规定每次在香港或者澳门逗留不超过7天，一进一出算一次。
港澳通行证续签
本人凭身份证及有效的《往来港澳通行证》办理，也可代办，代办人需携带身份证。（不同城市对加签可能有特殊规定，具体咨询户籍所在地出入境管理处，少数城市可以邮寄续签，如江苏连云港市）
办理时限：自受理之日起7个工作日。
费用：一次往来签注每个20元；二次往来签注每个30元。
特别注意：《往来港澳通行证》有效期不足6个月（部分城市是3个月）的或无足够空白签注页的不能办理，须按首次申请手续办理新的《往来港澳通行证》，同时申请签注。
参考资料来源：人民网-关于港澳通行证的问题