磺胺嘧啶的不良反应可能在轻度到严重之间变化。轻者可能出现恶心、呕吐和眩晕等轻微症状，这些通常不影响继续用药。然而，过敏反应较为常见，包括药疹，严重时可能发展为渗出性多形红斑、剥脱性皮炎甚至大疱表皮松解萎缩性皮炎。光敏反应、药物热和关节或肌肉疼痛也是常见的过敏症状。
长期大量服用磺胺嘧啶可能导致粒细胞减少、血小板减少，罕见时会引发再生障碍性贫血和肝损害。在服用过程中，由于药物乙酰化物结晶可能在肾和尿道形成，引起结晶尿或血尿，因此，患者需要增加饮水量，必要时可与碳酸氢钠一起服用，以促进药物排泄并降低对肾脏的不良影响。
更严重的不良反应还包括溶血性贫血和血红蛋白尿，尤其在缺乏葡萄糖6-磷酸脱氢酶的患者中更为常见，新生儿和儿童受影响更为显著。磺胺药也可能导致高胆红素血症和新生儿核黄疸，因为它们会竞争与胆红素结合的蛋白位置，而新生儿的肝功能尚未完全发育。
肝脏功能可能受损，出现黄疸和肝功能减退，严重时甚至可能引发急性肝坏死。肾脏方面，结晶尿、血尿和管型尿是常见反应，少数患者可能出现间质性肾炎或肾小管坏死等严重问题。
消化系统方面，恶心、呕吐、胃部不适、腹泻、头痛和乏力是轻微症状，但极少数情况下可能导致艰难梭菌肠炎，需暂停用药。偶有甲状腺肿大和功能减退的报道。
尽管磺胺嘧啶的严重不良反应较为罕见，如精神错乱、定向障碍、幻觉等中枢神经系统毒性反应，一旦出现，应立即停药。治疗期间需密切监测，一旦出现皮疹或其他早期反应征兆，应果断采取措施停止药物使用，以防止进一步的严重后果。
磺胺嘧啶本品为白色或类白色的结晶或粉末；无臭，无味，遇光色渐变暗。本品在乙醇或丙酮中微溶，在水中几乎不溶；在氢氧化钠试液或氨试液中易溶，在稀盐酸中溶解。