宁夏自治区气象局的内部结构设有多个职能部门，以确保高效运行和管理。以下是各部门的主要职责：
1. 讲座办公室（政策法规处、应急管理办公室）：这个部门负责协调局机关的工作，涵盖政务信息、机要、文秘、保密、宣传、档案、信访、办公自动化、督查督办等工作。它还负责制定地方气象法规，进行应急管理协调和安全生产管理，气象行政执法及行业管理，以及气象行政复议、应诉和法制宣传。此外，该部门还负责气象科技服务的组织管理和宏观协调，以及经营性国有资产的管理，雷电、静电灾害的防御工作。
2. 人事教育处：作为职能机构，人事教育处负责干部管理、机构编制、科技干部、劳动工资、在职教育和外事管理等事务。它还管理人才交流中心，致力于为职工提供全方位的服务，包括考核、奖惩、任免干部和人才培养工作。
3. 计划财务处：主要负责编制中长期发展规划和年度计划，监督实施，并协调双重计划财务体制。它负责全区气象部门的计划财务、基本建设、国有资产和统计等工作。
4. 精神文明建设办公室：原名政治思想工作处，后改称精神文明建设办公室，负责全自治区气象系统的思想政治工作和精神文明建设的组织管理。它负责机关及直属单位党组织的统一领导，管理工会、共青团、妇女、统战和侨务工作，协助地方党政部门进行全区气象系统的精神文明建设和思想政治工作，同时负责大院的综合治理。
宁夏气象局是中国气象局的下属单位，又是宁夏回族自治区人民政府的气象主管工作部门。于1958年建局，经过多年的建设和发展，尤其是改革开放以来，气象事业的发展已具有一定规模，气象服务工作在宁夏经济和社会发展中发挥着越来越重要的作用。