填图区的矿化异常包括多种地质异常（蚀变、铁帽、石英脉带等）、化探异常（分散流、水化学、次生晕、地气等）、物探异常（重力、磁法、放射性等异常）以及遥感异常等。主要采用以下方法进行调查与评价：
1.异常资料的收集和综合研究
应全面收集图区内的各类异常，准确标绘在地质图上，结合地质背景综合分析后筛选和排序，尤其要重视成矿地质背景优越、构造条件有利、多种异常叠加和套合好的异常的综合研究工作，提出地质填图中应优先安排和选择适当工作手段的配合，如通过地质剖面控制和加密地质填图路线等。
2.异常检查
主要通过专门性和更大比例尺的剖面实测、加密地质填图路线等控制，对区内已有的各类异常（尤其是前人1∶20万区域地质调查或是专门性的地质调查圈定的各类异常）进行检查与评价，并采集必要的样品等加以验证。如矿化较好时，可考虑少量的槽探揭露和更大比例尺的地质填图。剖面实测、地质填图中要重点进行矿化范围、蚀变类型与强度、与地质背景的相关性等方面的检查与分析。
（1）1∶20万地球化学异常检查
1∶20万地球化学测量与区域地球物理测量（布格重力、航磁）等已经覆盖了全国大部分地区，是研究成矿规律、发现新的矿产地的重要信息，在新的区域地质调查中应注意加强对该类异常的调查与检查。主要运用以下方法：
1∶20万地球化学测量资料收集 包括区域元素地球化学异常图、综合元素地球化学异常图，各异常元素组合的分类和强度划分等级，以及对各主要异常检查和评价的基本结论。此外，对某些重要异常还进行过土壤地球化学测量（次生晕），有矿化体样品和少量地表工程揭露。这些资料都应当注意收集和整理。
剖面和路线地质检查 在原异常区布设通过专门性的剖面测量和地质填图，检查原异常的基本地质特征，分析和评价异常区的地质背景，重点检查异常高点或重要矿化地段，必要时填制大比例尺地质图（草测），以研究控制异常的主要地质因素，推断异常源。对推测的异常源采集必要样品进行分析测试，证实其判断。
化探检查 1∶20万水系沉积物测量获得的异常，虽然在圈定异常时已考虑到异常的位移，在确定异常强度时也考虑了分散作用，但要进一步确定异常的确切位置、异常的真实强度，需要进行大比例尺土壤地球化学测量或岩石地球化学测量。土壤地球化学测量起到异常定位或缩小靶区的作用，而通过岩石地球化学剖面，可以确定矿化体、了解矿化特征和控制因素，包括富集层位、岩性富集程度、元素组合等。必要的话，还应投入一定的地气测量和生物测量工作，以探索覆盖层下矿化体的位置及分布。
地球物理检查 为了探索矿体埋藏状况，对出露矿体形态、产状、延深等做出推测，探测深部的盲矿体，以提供深部探矿工程设计的依据，需要投入一定的地球物理探测工作。常用方法包括磁法、激发电位法、自由电位法、激发极化法、中间梯度法等，对于获得的各种物探异常，应结合地质特征给予解释，并通过工程和样品予以验证或评价。
工程揭露 对地表露头不好的地段，尤其是通过物化探工作进一步确定的靶体，应投入一定的工程揭露。揭露矿（化）体、控矿构造、含矿层位等重要成矿标志，为评价异常提供定量资料。揭露工程主要采用探槽、浅井，甚至仅仅是剥土或剥去表层风化岩，应明确目的和主要任务，根据具体情况设计揭露工程。
区域对比 区域对比也是评价异常的一项重要内容，即将已知矿床矿点分布区1∶20万化探异常与未知区化探异常，在类型、衬度、元素组合、区域异常分带性等方面的对比，判断未知区异常源和评价异常。
（2）大中比例尺土壤地球化学（次生晕）异常检查
在许多矿区外围、重要矿化地段和重要远景区，一般曾有过1∶5万至1∶5000的土壤地球化学测量，圈定了地球化学异常，并对测区内的异常分布和主要异常进行评述。在系统、全面收集和整理的基础上，调查重点应放在对这些异常的分析和对比研究上。由于区调涉及的范围较大，区内可能已有多个小区完成过这类工作，因此应在分析对比的基础上，对重要异常重新认识，进行地面检查、取样、室内研究，必要时应动用一定的工程揭露并取样。对于露头连续的异常，可以进行更大比例尺的岩石地球化学测量。检查中在指导思想上必须避免“先入为主”，要善于发现问题、提出问题、不断探索。许多矿产地就是在这样的反复探索、反复研究中发现的。
（3）重砂异常检查
重砂异常是区域地质调查的一项重要检查手段，尤其是对原1∶20万基础地质调查的重砂异常检查尤为重要。重砂异常包括河流重砂和人工重砂两大类异常，绝大部分重砂样品是通过采集地表水系中重砂矿物获得的。重砂异常可以指示区域中的矿化类型、矿化区域，是寻找原生矿化地和砂矿床的重要线索。常见的重砂异常是根据出现的重砂矿物类型及数量来确定的。根据重砂矿物的稳定性序列可以判别其搬运距离，如一些硫化物只能近距离搬运，而一些副矿物可能远距离搬运。
对重砂异常的检查，包括对重砂异常区地质条件的调查和对重砂异常区水系沉积特征的研究两个方面。后者是为了了解重砂形成过程及条件，以便判别源区。通常有3种检查方法：
踏勘和路线地质检查 主要目的是确定异常区地质体的类型，各类地质体的出露面积和剥蚀程度等。收集和整理该区内的各种成矿现象、已知的地球化学和地球物理异常，进行综合分析，最终提出评价意见及进一步工作的建议和设计。
区域水系沉积物检查 了解区内水系的分布、分水岭位置，初步划出各级水系的流域范围。对现代水系沉积物及阶地水系沉积物，进行采样位置和剖面结构研究，调查其厚度、层序、分层组分、韵律等，对重点重砂异常点，还应分层采样，以了解异常出现的层位、共生矿物。
重砂验证检查 对于判别可能作为重砂源区的地质体，通过采集人工重砂样品进行验证。
（4）其他异常的检查
区域地球物理信息和区域遥感信息中，也有重要的异常。它们同样是矿产资源调查中的重要成矿线索和成矿标志，也应当进行必要的调查和评价。主要方法有：
收集与研究区域地球物理信息 包括航重、航磁、卫重、卫磁和地震联合地质剖面在内的多种地球物理异常，对于认识区域地壳结构、构造类型、岩浆活动，以及成矿史都有重要的意义。如认识莫霍面和康氏面的变化、断裂深度级别的划分、岩浆岩的分布规律及埋藏状态等。对于某些类型矿床，还具有直接的成矿意义，如与超基性岩有关的矿化、铁矿化等。对于这些异常的检查，重点是对它们与地质背景的空间和内在联系的分析。地球物理信息作为一种地壳的物理信息对于认识区域地质和成矿规律都是不能缺少的。此外，还有一些在矿区外围及深部的物探剖面、测井资料，都应注意收集和分析。
分析遥感信息 遥感地质是区域地质调查的主要内容之一。成矿作用和矿床的遥感标志研究，对于认识成矿条件，总结成矿规律，建立找矿标志系统是不可缺少的。高分辨率遥感图像上可以直接观察和识别采矿遗址，并能判别矿床工业类型，对于出露矿体可根据影纹和色彩判别矿化类型及规模。对于某些成矿现象标志如铁帽、蚀变带、石英脉等，能准确定位，认识其客观分布特征。此外，还有植物、水体等可指示矿化作用存在的间接标志。对于这些指示找矿的标志，需通过地面调绘确定其真实性。遥感地质还提供了许多间接找矿的资料，如岩体（环状构造）和区域性断裂（线状构造），地层产状与变质相（影纹和色调），岩性（影纹和色调）等，应注意这些信息的识别。
气体地球化学异常查证 近年来在某些地区开展的航空气体地球化学测量也有重大意义。除Hg外，还测定了一些稀有气体，如氦、氩、氡及其同位素。包括对常规气体（CO2、CH4、H2、H2S等）的各种地球化学研究，已逐步派生出了一门新的地球化学分支——气体地球化学。内生气体包括地幔生气作用、变质作用及浅层生物作用等。已经认识到深部来源气体有较高含量的CO2、CH4及特殊组分的稀有气体，而在一些地热田会出现气体异常。许多区域性深大断裂都是深源物质的通道，因而对区域成矿有重要的控制作用。一些侵入体也有显著的地气标志。此外，许多有机矿产其标志更为明显。对这些异常的检查，主要是判别它们与地质作用和矿化元素的空间和成因联系。
3.矿（化）点检查
在地质填图中研究已知矿（化）点，发现新的矿（化）点是一项基本任务，其目标是为了发现新的矿产地（矿床或矿体），扩大本区的资源储量，提高研究程度。矿（化）点检查主要包括对矿（化）点产出地段成矿地质背景的调查，对区内一些重要成矿现象出现地进行解剖，在已知矿床外围及深部探测新的矿体（隐伏矿体）。地质填图中要注意以下工作：
古采矿活动的调查 如古代或近代人类冶炼、采矿活动的遗迹，包括地名、老矿坑、旧矿硐，炼铁遗址、废石堆等。许多矿床的地名本身指示了曾有过采矿活动，如银硐沟、铅硐山、铜厂坡等，多数小地名在1∶5万地形图上都有反映，应予注意。更直接的标志有老矿坑、矿硐等，更应重视。如果仍残留有少量矿石或矿化体，应采集样品。
对矿床周边地区的调查 主要依托对已知矿床成矿规律和控矿因素的研究。大多数的矿床勘探工作，其范围都是有限的，在延长方向进入新的填图区时，重点应放在矿体空间分布规律、控矿条件及找矿标志的综合分析上，提出本图区的矿体可能矿化层位、矿化岩性、矿化区段的预测。
4.成矿地质背景与控矿条件分析
地质填图中要注重地、物、化、遥多因素综合分析，而矿产调查中同时要地、物、化、遥多手段综合运用，这是二者在手段上的主要区别。
通过剖面实测、地质填图，结合邻区和区域成矿地质条件、已发现各类矿产等情况，分析这些已有的和新发现的各类找矿线索、找矿标志等，重新认识和分析其与地层、构造、岩浆作用、变质作用等地质背景的关系，探讨控矿条件。强调要用新的区域地质填图成果分析和解释可能的成矿机制、控矿因素，进而提出找矿方向。成矿的地质标志，如广义的铁帽（次生产物）、石英脉带、蚀变带，以及抗风化的原生矿物等都是有意义的。地球化学标志更为广泛，有原生晕、次生晕、分散流、水化学、地气等异常，地球物理标志包括磁法、电法、重力、放射性等异常。遥感成矿标志是近年来不断总结和认识的一些新标志，在多波段遥感信息中，容纳了大量成矿信息，可采用影纹解释、光谱解释、似彩色合成等方法，建立一个区域的遥感解译系统，其中包括成矿解译系统。