优化科技投入配置是一国扶持高新技术产业发展、促进科技成果转化的重要手段。各国关于科技投入的差别主要体现在投入规模、投入强度、投入结构等方面。
（一）投入规模
R＆D投入是测度国家R＆D规模、评价国家R＆D整体实力的重要指标。各国R＆D总额总体呈上升趋势，美、日、德、韩等国始终保持较高的投入量。进入新世纪，我国的R＆D投入经费投入持续快速增长，年平均增幅超过20%。虽然我国在R＆D投入总额上逐渐增多，2011年总量居世界第三位。但与发达国家相比，总体投入还是不足。
（二）投入强度
投入强度是指R＆D与GDP之比，不仅是测度一个国家R＆D投入强度的重要指标，同时也是评价一个国家经济增长质量和经济发展潜力的重要指标（连丽，2006）。美、日、德、法、韩等发达国家R＆D投入占GDP的比例大都保持在2%以上，日本超过3%，以色列甚至超过4%。高水平的R＆D经费投入强度是这些国家具有较高创新能力的重要保障。我国的R＆D投入强度自2002年开始已超过1%，2011年达到1.84%，在发展中国家处于首位，但与大部分发达国家相比，还明显偏低。反映出我国主要经济增长方式仍然以高生产资料投入的粗放型方式为主，科技对经济增长的作用仍然有待加强（李鹏，2009）。
（三）投入结构
在R＆D经费的来源上，发达国家以企业为主要力量，大多数发达国家企业R＆D经费占全部R＆D的比重都在60%以上。2011年，我国的R＆D经费支出总额中来自企业的资金占73.4%，企业成为我国R＆D活动资金的投入主体，我国实现了由政府企业双主型向企业主体型的转变。在R＆D经费的使用结构上，发达国家企业所用的比例在70%左右，我国近年来的比例也和这些国家相近。
R＆D活动按属性可分为基础研究、应用研究和试验发展3种类型。3类R＆D活动的投入比例，在各个国家因为国情不同，而有一定的差别，在各国科技发展的不同阶段也有差别，但在一定时期内都保持相对的稳定。现阶段一般为：基础研究12%～20%，应用研究20%～25%，试验开发为50%～70%。我国2011年基础研究经费在全国R＆D经费支出总额中的比重仅为4.7%，而多数发达国家都在10%以上。应用研究所占比重为11.8%，比2010年回落了0.9个百分点，与美国和日本相比，也分别低6个百分点和10.5个百分点。说明我国研发经费支出中基础研究和应用研究支出所占比重偏低的现象仍未得到根本改观，原创性的研究较少，企业在自主创新投入上目光尚不够高远。