一、突出分析重点。突出分析重点，即抓住预算执行中的重点问题、主要矛盾进行综合分析。重点越突出，分析越容易出成果。预算执行审计涉及的情况相当多，综合分析中如果面面俱到，什么情况都分析，重要问题往往被一般情况所掩盖，耗事费力，难出成效。突出分析重点，注意抓重点领域、重点部门、重点资金的审计综合分析。如有预算资金分配权的行政主管部门、有罚没收费权的行政执法部门、接受财政补贴数额较大的公益事业单位等等，都应列为分析重点。
二是注意抓重点问题的分析。通过对预算执行情况的真实性、合法性、效益性分析，从中发现“数额大、范围大、危害大、影响大”的问题。如预算执行中的严重弄虚作假、违纪违规问题，预算内外资金的管理不善问题，宏观财力增长趋缓问题，新的经济增长点的挖掘问题等等，都比较重要。从今年的审计情况来看，要重点突出对资金量大、有预算资金分配权和下属单位多的部门审计情况的综合分析，促进规范财政 财务管理 ，强化对政府部门权利运行的约束和监督。围绕这些重点问题进行分析，党政领导的关注度高，产生的效果往往比较大。
三、坚持实事求是。实事求是不仅是预算执行审计的本质要求，也是开展综合分析工作必须遵循的原则。离开了实事求是，综合分析就失去了赖以存在的基础，甚至会得出错误的结论。坚持实事求是，是从实际出发，以事实为依据，以法律为准绳，客观公正，成绩不夸大，问题不缩小，在全面搞清事实的基础上，深入解剖，分清责任。坚持这一原则，要注意防止结论在先，分析在后的主观做法。
四是把握事物的本质。预算执行审计中的情况比较复杂，有些现象并不反映事物的本质，甚至将事物的本质掩盖起来。许多初始状态的情况，有时还混杂着一些不真实的东西。比如预算收支平衡，通过对审计情况的综合分析，我们会发现存在一些应收未收、应减支而未减支、应投入而未投入的问题。在这种情况下，坚持实事求是的分析原则，通过对大量的表象情况进行去粗取精、去伪存真、由此及彼、由表及里的分析提炼，就会较准确地揭示出预算收支中这种人为平衡的本质问题。
另外，要注意要把握好“三个有利于”原则。在新旧体制的交替过程中，由于立法工作跟不上，往往会遇到一些无法可依的问题。即便是有法可依，又会因法规的过时或不完善而难于适用。坚持“三个有利于”原则，实事求是地分析问题，才能找到解决问题的钥匙。
分析要有逻辑性。逻辑性是指综合分析过程中要遵循逻辑思维规律，做到观点正确，问题清晰，判断恰当，推理有据，论证有说服力。缺乏逻辑性，分析问题时，分析者往往感到面临一团乱麻，无从下手，最终难以写出好的分析文章。因此，讲究和把握分析逻辑十分必要。分析要具备逻辑性，就必须掌握并能运用好辩证逻辑和形式逻辑的 基本知识 ，特别是要遵守好形式逻辑的基本规律。即，遵守同一律，紧紧围绕主题展开分析，做到概念清楚，观点正确，前后同一；遵守不矛盾律，写作分析文章时，思维要保持前后一贯，避免自相矛盾：遵守排中律，排除错误的判断，保留正确的结论，防止出现同时否定矛盾双方的思维错误；遵守充足理由律，在分析论证问题时，要有充足的理由。
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