7款物种分类(进化树地位)信息检索工具使用方法

如题所述


探索物种进化之旅,达尔文的《物种起源》为我们揭示了自然法则。关于物种进化的疑问,如人类是否仍在进化以及生命进化的目标,引发了思考。接下来,我们将介绍七款实用的物种分类(进化树地位)信息检索工具,它们在生物信息学研究中扮演着重要角色。



    Lifemap - NCBI的在线工具,通过交互式探索物种分类,类似Google Maps,通过缩放和平移浏览物种分类。其特点包括交互式节点、详细信息获取和实时更新。网址:lifemap-ncbi.univ-lyon1.fr...


    ITIS - 包含北美和世界各地权威分类信息,查询物种学名,Haemonchus contortus在北美分类中未找到,适合查找广泛信息。网址:itis.gov/


    Tree of Life Web Project - 专家和业余者合作的数据库,提供生物多样性的全面信息,包含物种的进化历史。网址:tolweb.org/tree/


    ITOL - 互动生命之树工具,支持用户上传树结构和数据,提供了多种可视化格式。网址:itol.embl.de/


    其他工具如iPhylo、NCBI Taxonomy Browser、Uniprot Taxonomy等,也提供不同方式的物种分类检索。



以上工具帮助我们理解物种的进化位置,但生命之树的构建仍在持续,新物种不断被发现。易明学院提供R系列课程,包括软件包和课程支持。想了解更多,可访问易明学院或相关参考文献。


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