结局：叶湘伦（周杰伦饰）认识的那个小雨已经死了，而他最后见到的小雨，其实不认识周杰伦，因为最后周杰伦在旧琴房弹secret的时候，当时时间紧迫，他弹奏的速度有些快，所以他可能穿越到了20年前更早的时候，那个时候小雨还没有在旧琴房发现secret的琴谱。
在1999年周杰伦毕业的时候，小雨曾穿越到了他的毕业典礼上，当时的她因为大家都不相信她，已经严重抑郁，而周杰伦最后穿越回去见到的小雨是正常人的样子。
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《不能说的秘密》的剧情简介
叶湘伦（周杰伦饰）与父亲（黄秋生饰）相依为命，他的父亲是淡江艺 术中学的训导主任。叶湘伦自小在他的培养下，拥有非凡的音乐才华。这天是叶湘伦转读淡江艺术中学的第一天，当他跟着同学晴依（曾恺玹饰）参观校园时，突被一段神秘的钢琴乐曲吸引。
湘伦随着琴音引领，走进一间旧琴房，发现弹琴的是一位清秀脱俗的女生路小雨（桂纶镁饰），两人虽然没有交谈，但在四目交投之间，双方都泛起微妙的感觉。就这样，美丽的爱情故事开始了。
而当湘伦问及他们第一次见面在百年琴室所听到的神秘乐曲时，小雨却回答：“这是一个不能说的秘密。”之后，二人陷入热恋，但叶湘伦觉得小雨充满了神秘，却无法进一步了解她。
某天，叶湘伦约小雨到琴房见面，叶湘伦以为晴依是小雨，跟晴依接吻时被小雨看到，之后叶湘伦就没有再看到小雨。于是，叶湘伦到处寻找小雨，终于发现了那个小雨所说“不能说的秘密”的全部真相 。
参考资料来源：百度百科—不能说的秘密
他为了小雨放弃了他未来的一切，他回到的过去是小雨第一次弹琴的更早的以前，可以说那时候，钢琴穿越只有杰伦一个人知道，他为了和小雨永远在一起，他肯定选择了永远不回到未来了。
因为他这样做，历史也改变了，之前发生的一切都消失了，可能他爸的儿子也不是叶湘伦了，小雨永远也不会发现那可以穿越的琴谱了，所有的悲剧都因为伦的不回去而消失了，多的只有相爱的两人，而知道一切秘密的人也就变成了湘伦一个人。
其实这才是最美好的结局，没有人疯没有人死，没有穿越，有的只是最简单的校园爱情。
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电影中的秘密：
小伦与父亲相依为命，父亲是淡江艺术中学的音乐老师，小伦自小在他的熏陶下，拥有非凡的音乐才华。小伦转读淡江艺术中学的第一天，当他参观校园时，突被一段神秘的钢琴乐曲吸引。小伦随着琴音引领，走进一间百年琴室。
小伦发现弹琴者是一位清秀脱俗的女生小雨。两人虽然没有交谈，但在四目交投之间，双方都泛起微妙的感觉。
小雨是小伦的同班同学，由于小雨上课总迟到，故经常被迫和坐在后排的小伦坐在一起。两人的感情因此突飞猛进。但每当小伦问及那天在琴室听到的神秘乐曲时，小雨总是模棱两可地回答：“那是一个不能说的秘密。”
最后他发现小雨跟他不是一个时代的人,它们整整相差了20年.小雨也是小伦爸爸的学生.小雨读书的时候。
有一天突然发现音乐教室的钢琴底下有一本乐谱。那本乐谱的名字就叫做秘密，乐谱上面还说如果把这段钢琴曲子快速弹奏完毕，首次看见的人就是你将来喜欢的人。小雨一边弹奏，那间教室的物品就一直移动，不知不觉，她就来到了20年后的这间教室，第一眼就看见了被音乐吸引过来的小伦。
本回答被网友采纳为什么这 么说，大家要知道影片是穿越式的故事，提到穿越就不得不提到相对论、平行空间、蝴蝶效应，如果全部合起来的话那穿越空间就是悖论是不可能出现的，这样说就 有些让人云里雾里的感觉。不过时空穿梭还在学术界激烈的讨论，我们就不关心了，只是来看看本片中的故事。在叶湘伦与路小雨相遇的时空中，原来的路小雨穿越 了时间来到了叶湘伦所生活的时间，也就是说两个人是在同一个时空内。在这个叶湘伦的时间里，路小雨已经死了，路小雨的妈妈也已经疯了。而在路小雨的时间 里，叶湘伦还没有出生，路小雨是在进行时。到了最后路小雨还是因为看到晴依与叶湘伦接吻而回到自己的时间内因为哮喘发作写完涂改笔写的几个字后就死了，而 叶湘伦因为追赶路小雨又从橄榄球队那两个人口中联想到事情有些不对，去了路小雨的家发现路小雨早已经在20年前死去了并且发现了路小雨与自己父亲的合照， 并回去问了父亲所有事情。知道前龙后脉的叶湘伦跑进了正在拆毁的音乐教室内弹起了可以穿越时空的钢琴曲secret，而此时叶的父亲看到secret里路 小雨写给叶湘伦最后的绝笔，并且折开一角发现了叶湘伦的名字顿时知道了所有便想去阻止叶湘伦。最后叶湘伦还是弹奏完曲子来到了20年前，但如果你注意看的 话，最后叶湘伦见到的路小雨是不认识叶湘伦的，也就是说叶湘伦回到了路小雨没有穿越时间来找叶湘伦的时空内，准确点说叶湘伦去了另一个平行的时空内，而原 本的时空里回到了自己时间的路小雨正在慢慢的死去。最后是3个悲剧人物的出现，叶湘伦的父亲、路小雨、路小雨的母亲，他们是完成时了已经无法阻止了，而叶 湘伦却在另一个时空里跟一个没有穿越过时间的路小雨在一起了，不能不说是一个时间空间上的讽刺。
可能大家看我前一段的解释有些头大，但事实是的确是这样的，爱着叶湘伦的路小雨在自己的时间里死去了，爱着路小雨的叶湘伦穿越的不是时间而是时空和一个 不认识自己的路小雨在一起了。叶湘伦时空里的路小雨到最后死前连叶湘伦爱不爱自己都不知道，就这么不明不白的死去了。
时间和空间是两个词，合在一起才是时空，如果深究只能陷入学术的悖论中。
从一开始，大家一直以为叶湘伦和晴依是两个误会的平行线，其实在这个时间段里路小雨是除了她“前来”第一个见到她的人外所有人都看不到的，这也就解释了 为何晴依以为叶湘伦一直是对着自己好，这也拜导演将晴依和路小雨恰到好处的安排。路小雨所说的从音乐教室到叶湘伦的教室走108步，因为她来到这个时间里 只有第一个看到的人能见到她所以才会闭着眼睛走到叶湘伦的教室窗户前看到叶湘伦。但也有些失误的时候，有一次晴依做到了叶湘伦的座位上，就是那次斗琴，晴 依可以和路小雨说话，而叶湘伦不知道路小雨就一直在看着自己斗琴。
为何那晚是晴依在7点来到了音乐教室并吻了叶湘伦，如果看不到最后很多人还以为是晴依私自留下了纸条来见叶湘伦。其实所有的人除了叶外没有人见过小雨， 橄榄球队的两个人也正因为如此才说在舞会上只看到了叶湘伦一个人跳舞，所以班级里的人都以为叶的纸条是传给晴依的因为晴依和叶走的比较近。也就解释了小雨 为何在另外一间屋子里，而叶却在隔壁等她，因为小雨根本就没有收到过叶的纸条，当她看到晴依亲吻叶的时候以为叶爱上了晴依。当时大勇为何看得到小雨是因为 当时小雨以为叶来了，开门第一个看到的却是大勇，而在玻璃后面叶怎么看也看不到小雨正是因为第一个人是大勇。
说到最后其实通篇都是悲剧，悲剧的路小雨，悲剧的晴依，悲剧的叶父、路母，乃至最后的叶湘伦一个只能让路小雨看到的叶湘伦，并且是一个没有穿过时间爱过自己的路小雨。本回答被网友采纳
“一天一个苹果、十五个苹果，你看你多少天没来上课了？”
其实穿越时空每天只能限制一次的，所以路小雨才记得从琴房到教师刚好一百零八步，闭着眼小心的走过去，珍惜每一次的机会。
那十五天里，小雨第一眼看的可能都不是湘伦，而不是没来；小雨就在湘伦眼前，却没有被感觉到的徘徊了十五天，那是怎样的一种煎熬... ...
明白了上面的穿越时空规则，路小雨为什么要闭眼走路、纸条怎么到晴依那里去了、大勇怎么看的到小雨一系列的事情就很容易解释了。 二、路小雨死了?
是的，证据就是小雨的头发。
细心的人会发现：路小雨五个月没有穿越时空那段时间，头发比刚认识叶湘伦的时候头发长了；毕业典礼和叶湘伦拥抱、立可白那几段都是较长的头发。
而叶湘伦穿越时空后见到的小雨头发是短的，没有长！
而且也不是毕业典礼那天，路小雨正在写功课；而且似乎不认识叶湘伦，应该说就是不认识。
小雨确实死了、某种程度上是本片的一个悲剧之一。 三、叶湘伦去了哪里？
这里我需要提出一个概念，不同的时空可以被看成是不同的盒子。
我把99年叫做时空A，79年叫做时空B。
电影的大部分篇幅讲的就是：时空B的小雨B穿越时空来与时空A的湘伦A产生的一段恋情，当知道一切的时空A的湘伦A也希望穿越时空的时候，湘伦A来到的不是时空B，而是时空C，遇到了小雨C；时空C就是在小雨发现《秘密》琴谱之前的时候，一切都还未发生 四、如何解释毕业照？
穿越时空的规则就是只有第一眼看到的人才能看到你，毕业照说明时空C的所有人都看的到湘伦A；解释就是作为穿越时空介质的钢琴被摧毁，叶湘伦无法回去；时空A的湘伦A永远的留在了时空C，规则失效。 五、为什么叶湘伦去了第三个时空？
时空B的路小雨B每次都成功的来到了时空A，时空A的叶湘伦怎么就时空错位了呢？
《不能说的秘密》的原声电影CD就有2个版本的《秘密》钢琴曲，一个是路小雨的正常版，一个是叶湘伦的加快版。叶湘伦当时情况紧迫，所以弹出了加快版的《秘密》回到了更早的时空C。 六、99年时空A的小雨存在证明，99年小雨妈妈没疯
这时的小雨应该是四十岁左右的中年人。
第一次小雨B带湘伦A去她家的屋顶那段，上楼之前有拍到一个中年女人看着叶湘伦上屋顶（她也是看不到小雨B）的，那个人不是小雨的妈妈，就是中年的小雨A。
第二次小雨B很多天没去“上课”，湘伦去小雨家遇到她妈妈买了很多苹果。苹果当然是给小雨的，而不是因疯癫思念死去的小雨。
第三次湘伦去小雨家，小雨妈妈说小雨在休息，然后进屋去了，同时镜头切到了小雨家二楼，叶湘伦的动作和小雨妈妈刚刚进去时的动作吻合，二楼看的人不是小雨妈妈，而是中年小雨A。
第四次湘伦去小雨家，也是第一次进去；也是发现小雨不见以后的事，也是小雨发现湘伦手上晴依的手链而悲痛过度病发而亡的时候。
小雨的妈妈要湘伦进屋，说小雨就在屋子里听歌，确实小雨A就在屋子里听歌，可是对应的二十年前的小雨B也是在湘伦进屋前死了，时空A的历史因为时空B的改变而改变了，同时湘伦发现了小雨的手绘湘伦肖像，同时小雨的妈妈哭着说，“妈妈应该相信小雨的。”这个时候小雨的妈妈也被历史改变了，认为小雨已经死了。
之前小雨的妈妈一直都说小雨在，不是疯话；确实此前存在小雨A。 还有一个证据是“小雨回到20年以后可以看到湘仑，同样可以看到他的妈妈，和她自己，
小雨妈妈问，看到妈妈了 吗？小雨说妈妈还是和以前一样美丽，因为她看到的正是中年黑发的自己，而她妈妈已经白发了
结局解析
时空A叶湘伦的爸爸失去了他的儿子，也许是他没有保守小雨秘密的惩罚吧，算一个悲剧；
时空B路小雨的妈妈失去了她的女儿，因为女儿翻看了《秘密》琴谱，算一个悲剧；
时空B的路小雨不被大家相信，甚至被取笑，受尽折磨，含着无尽的悲痛死去，算一个悲剧；
时空A叶湘伦是想去时空B找寻爱着他的路小雨B，却没有办法再见，成了永恒的悲剧；
大勇因相信小雨而自己被人打傻、晴依错误的爱上叶湘伦却无果、都算的上是悲剧... ...
最后时空A的湘伦A去了时空C，改变了时空B和时空A的所有历史，阻止了所有悲剧的发生，成为完美的大结局，也算是一个比较戏剧化的结尾吧。 （这也是观众们想看的结局）
交天下爱看电影的朋友