新农合报销比例标准地区不一样报销也可能会存在差异，大致报销比例标准如下：1.门诊看病报销比例标准（1）村卫生室看病就诊报销比例是60%，每次看病药费限额10元，卫生院医生临时补液处方药费限额50元。（2）镇卫生院看病就诊报销比例是40%，每次看病各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额100元。（3）二级医院看病就诊报销比例是30%，每次看病各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。（4）三级医院看病就诊报销比例是20%，每次看病各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。2.住院报销比例标准（1）住院报销范围一是辅助检查包括心脑电图、X光透视、拍片、化验、理疗、针灸、CT、核磁共振等各项检查费报销限额200元；二是手术费（参照标准，超过1000元的按1000元报销）。三是60周岁以上老人镇卫生院住院就诊，治疗费和护理费每天补偿10元，报销限额200元。（2）住院报销比例在镇卫生医院住院报销比例是60%；在二级医院住院报销比例是40%；三级医院住院报销比例是30%。3.大病报销比例标准（1）参加农村合作医疗保险的住院病人一次性或全年累计应报医疗费超过5000元以上的进行分段补偿，如果住院花费开销在5001-10000元补偿65%，住院花费开销在10001-18000元补偿70%。（2）镇级合作医疗住院及尿毒症门诊血透、肿瘤门诊放疗和化疗一年补偿限额1.1万元，意思就是说新农合报销最高额度在1.1万元，更高的费用只能自己承担。以上报销比例标准仅供参考，具体详细标准详情以当地为标准。新农合发生这4种情况不予报销！1.没有在新农合定点医疗机构就医的不予报销！如今医疗机构越来越多，看病的选择性也越来越多，农民朋友只有选择到新农合的定点医疗机构就诊，如果不属于新农合指定医疗机构就医不能报销！2.没有批准私自转院治疗不予报销！农民朋友在指定医院看病时，可能需要到医疗条件更好的医院去进行治疗，但一定要先去医院办理转院手续，因为只有得到现在医院的转院批准，才符合新农合的报销要求，不然到时会报销不了！3.报销超过时限要求的不予报销！农民可能以为只要在医院看了病，随时都可以进行报销，由于农务忙没有第一时间去报销医药费，当想起来的时候，发现已经超过报销时限要求，就会导致无法报销。4.特殊医疗费用不予报销特殊事医疗费用指的是矫形、整容、镶牙、假肢、脏器移植、会诊费等飞鹰，用新农合是报销不了的。
《中华人民共和国社会保险法》第二十三条职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。