南京的本科大学有：
1. 南京大学
2. 东南大学
3. 南京航空航天大学
4. 南京理工大学
5. 南京师范大学等。
南京大学是南京的一所历史悠久、声誉卓著的综合性大学。该校拥有多个国家级学科重点，以及世界一流的科研设施和实验室。南京大学的学科涵盖了文、理、工、管、法、医、教育等各个领域。
东南大学在工科领域享有很高的声誉，特别是在电子、通信、建筑和交通工程等方面有着突出的优势。学校地处南京市中心，拥有现代化的教学设施和实验室。
南京航空航天大学是中国著名的航空航天类高校之一，以工科为主，同时也在理学、管理学等领域有所建树。该校的航空航天工程专业在国内外都享有很高的声誉。
南京理工大学是以理工科为主的全日制本科大学，特别是在化工、材料、机械等领域有着深厚的学科积淀和研究成果。学校位于南京市的江北新区，环境优美，教学设施先进。
此外，南京还有许多其他优秀的本科大学，如南京师范大学、南京医科大学等，涵盖了各类专业，为不同兴趣和志向的学生提供了广泛的选择。这些学校共同为南京乃至全国的教育事业和社会发展做出了重要贡献。