齐齐哈尔市中医院以其先进的医疗技术在省内享有盛誉。医院已经成功实施了一系列高难度手术，例如活体肾移植、法鲁氏四联症矫正术、冠状动脉搭桥术，以及对巨大脑瘤的摘除术。妇科方面，医院能够进行肿瘤的根治手术，包括卵巢自体移植术，这些技术在治疗上都处于前沿水平。
在骨科领域，骨关节镜治疗骨关节病技术独具优势，其精湛技艺在全市范围内独占鳌头。此外，医院的显微镜下颈腰间盘摘除术和断肢再植技术，也展现出卓越的专业能力，处于领先地位。
腹腔镜技术在齐齐哈尔市中医院的运用尤为突出。自1997年引进以来，医院已成功实施了近万例胆囊切除手术，凭借其精湛的技艺，腹腔镜技术在全市占据核心地位。妇科腹腔镜手术方面，已完成600余例，成功率高达100%，并因一项省级新技术应用二等奖的获得，彰显了医院在该领域的先进水平和专业实力。
齐齐哈尔市中医医院（齐齐哈尔市第三医院）是国家级示范中医医院暨三级甲等中医医院，齐齐哈尔市中西医结合医院，黑龙江中医药大学齐齐哈尔临床医学院，哈医大二院协作医院，天津肿瘤医院齐齐哈尔诊疗中心；全市首批城镇职工居民医保定点单位，全市各大商业保险公司医疗定点单位；是我省西部地区设备先进、人才济济、科室齐全、分工精细、特色突出、有自主研发能力，集中医、中西医结合医疗、预防保健、科研教学、技术指导、咨询服务为一体，具有鲜明的中医特色和优势的现代化大型综合性中医医院。