距离的话我没有考量，从航线时间角度衡量用时比较短的几条商业航线：
连云港到徐州：30分钟
长治到太原：30分钟
福州到厦门：40分钟
北京到大同：40分钟
武夷山到厦门：45分钟
武汉到恩施：60分钟
阿勒泰到乌鲁木齐：50分钟
广州到香港：约55分钟
广州到汕头：55分钟
南通到常州，重庆到成都没有直航航班，包括只有140公里的海口到湛江，而且很多短航班现在都已经取消了。
另外深港澳之间有空中快线直升机，几十公里，十几分钟就能到
但是还有特例就是（来自论坛）：
记得以前见过一张浦东到虹桥的登机牌。价格好像是90？调度转场的飞机，偶尔也对外卖，那个帖子的楼主是因为来不及赶过去，机场给想的解决方案。像这样的例子还有北京T2到T3，见过有人发帖。
参考资料：http://ar.newsmth.net/thread-b19204962077ab-1.html