端午节挂艾草原因如下：
1、消灾防害
端午节是整个热天的开端，我们熟知的“五毒”也开始活跃。而且很多人认为端午节位于春夏之交，五月是毒月，五日是毒日，五日的中午又是毒时。所以大家在这一天会特别注意消灾防毒，艾草是具有驱蚊虫以及净化空气等多个作用，所以大家在端午节挂艾叶也成为了一个传统习俗。但实际上这种习俗不仅仅只是对节日的点缀，它的存在是具有一定科学依据的。
2、驱邪
在古人看来，艾草会散发香气，而这种香气可以起到驱邪、辟邪的作用。在端午设置种种可驱邪的花草，来源亦久。最早的如挂艾草于门，《荆楚岁时记》：“采艾以为人，悬门户上，以禳毒气。”这是由于艾为重要的药用植物，又可制艾绒治病，灸穴，又可驱虫。
3、招福治病
艾草的功效作用非常多，还可以入药治疗很多疾病。艾草能芳香通窍，常闻能令人头脑清晰、耳聪目明、记忆力增强，可预防感冒，还能活络通筋。同时，还可以燃点艾条用作治病，称为艾灸法。所以在端午节将门口挂上艾草也是为了达到身体健康的作用。
端午节要挂艾草有以下几点解释：
1、端午节将艾草挂在门上，预示一家人一年中身体健康，好运随身。有关艾草可以驱邪的传说已经流传很久，主要是它具备医药的功能而来。艾草是一种药用植物，全株均可入药，生长范围广泛，几乎在全国各的均有生长，又名艾蒿，《本草》中记载：艾叶能灸百病。
2、艾叶可以散发一种独特的香气，可以有效驱赶蚊虫，使得蚊子，苍蝇等毒虫不敢靠近，提高安全性。谚语说：“清明插柳，端午插艾”。在端午节这天，人们把插艾草和蒲草作为重要内容之一。“艾”，又名家艾、艾蒿。它的茎、叶都含有挥发性芳香油。它所产生的奇特芳香，可驱蚊蝇、虫蚁，净化空气。
3、因为传统仪式的流传，起到祈福的作用。在古代，端午季节雨水较多，全国各地都已经进入汛期，古代人们把这种情况归结为水怪的兴风作浪，而艾草叶子形似宝剑，可以起到震慑作用。当然，这些都是迷信思想作祟，但是人们祈福的美好传统确实保留了下来。
因为古人插艾是有一定防病作用的。端午节也是自古相传的“卫生节”，人们在这一天洒扫庭院，挂艾枝，洒雄黄水，饮雄黄酒，激浊除腐，杀菌防病。
这些活动也反映了中华民族的优良传统。端午节上山采药，则是我国各民族共同的习俗。艾，又名家艾、艾蒿。它的茎、叶都含有挥发性芳香油。
中医学上以艾入药，有理气血、暖子宫、祛寒湿的功能。将艾叶加工成“艾绒”，是灸法治病的重要药材。
艾叶本身所含有的物质可以起到杀菌消毒的作用，所以，用干枯后的艾叶煮水可以达到同样的效果。很多人会用艾叶煮水来洗澡或者熏蒸，也有人用来泡脚，都可以起到同样的效果。
过去插艾草、菖蒲是为了避毒虫，现在是避煞气，防止传统位理学上禁忌入内的邪气。切记：一定要在下午3点前插艾草和菖蒲。