派出所所长和指导员相比，派出所所长官职大。派出所指导员副科级别。
派出所所长就是派出所的负责人。派出所所长很多兼任党支书书记。
指导员，政治指导员的简称。是指解放军连级单位以及武警部队中队的政工干部，是和连长、中队长平级的首长。派出所所长具体负责所属片区的安全。派出所分为两大类，一类是地方公安机关的派出所、警察是公务员，一类是公安边防部队（也就是武警边防部队）的边防派出所、警察是现役军人。解放军实行的是“党指挥枪”原则（党对军队绝对领导），指导员一般担任连队的党支部书记，连长、中队长为党支部副书记。
指导员也是政治指导员的简称，派出所指导员主要负责派出所的政治工作。
依地区、社会情况、人口多少等诸因素的不同可分别设立城市派出所、农村派出所、水上派出所、铁路派出所、工矿派出所、治安派出所等。
派出所设所长、指导员根据地区行政级别设政委、教导员、户籍民警、内勤民警、辅警，大多数设有案件民警和社区民警，有的还设有巡逻民警。
关于教导员的概念，字典上是这样写的:“是军队、武警、公安、民兵、联防等单位中一级首长的职务。一般有营教导员、派出所教导员、交警队教导员、消防队教导员、县中队教导员、治安大队教导员、刑侦大队教导员等。
在派出所里，有所长和指导员，是同一机构内分工不同的级别领导。辅导员的主要职责是做好政治思想工作和党务工作。所长的主要职责是综合性的，比如办案、户籍管理等派出所的业务工作，派出所的日常管理(人事、待遇、财务、办公后勤等。)，还有基本上除了教官以外的所有派出所事务。
在派出所的实际运作中，基本上是派出所所长说了算，指导员往往只是一个空缺的岗位。像协助主任的副主任，在所里分管一些工作，但是级别比副主任高。
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【法律依据】
《中华人民共和国公务员法》第十九条
公务员职级在厅局级以下设置。
综合管理类公务员职级序列分为：一级巡视员、二级巡视员、一级调研员、二级调研员、三级调研员、四级调研员、一级主任科员、二级主任科员、三级主任科员、四级主任科员、一级科员、二级科员。
综合管理类以外其他职位类别公务员的职级序列，根据本法由国家另行规定。
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