三峡地区的国家一级保护植物是崖柏。
珍稀濒危物种的拯救保护，是生物多样性保护工程中的重要内容。长江珍稀植物研究所（前身为三峡苗圃中心）自2007年建园以来，一直坚持珍稀濒危植物保护工作。
为确保引种植物成活率，科研人员坚持遵循植物的生物学特性以及生态环境和植被类型相似的原则，将引种植物分别定植于长江珍稀植物研究所的植物园和温室大棚及各专类园，指派专人管护。
经过多年的不懈努力，目前，长江珍稀植物研究所已成功收集和保存特有、珍稀、濒危植物共计1300余种约2.9万余株，其中人工繁育成功的有100多种。
人工繁育成功的珍稀植物有国家一级保护植物崖柏，国家二级保护植物疏花水柏枝、丰都车前等，均已成功应用于坝区生态修复和专类园建设。
国家一级保护植物：
1、珙桐，国家一级重点保护野生植物，为中国特有的单属植物，也是全世界著名的观赏植物。色花奇美，是1000万年前新生代第三纪留下的孑遗植物，在第四纪冰川时期，大部分地区的珙桐相继灭绝，成为了植物界今天的“活化石”，被誉为“中国的鸽子树”，又称“鸽子花树”“水梨子”，野生种只生长在中国西南四川省和中部湖北省和周边地区。
2、桫椤，别名蛇木，有“蕨类植物之王”赞誉。桫椤是能长成大树的蕨类植物，又称“树蕨”。是已经发现唯一的木本蕨类植物，极其珍贵，堪称国宝，被众多国家列为一级保护的濒危植物，有“活化石”之称。
3、金花茶属于山茶科、山茶属，与茶、山茶、南山茶、油茶、茶梅等为孪生姐妹，是国家一级保护植物之一。金花茶的花金黄色，耀眼夺目，仿佛涂着一层蜡，晶莹而油润，似有半透明之感。金花茶单生于叶腋，花开时，有杯状的、壶状的或碗状的，娇艳多姿，秀丽雅致。
以前，人们没有见到过花色金黄的种类。1960年，中国科学工作者首次在广西南宁一带发现了一种金黄色的山茶花，被命名为金花茶。国外称之为神奇的东方魔茶，被誉为“植物界大熊猫”“茶族皇后”。