连锁店是统一配货的，旗舰店是官方的龙头店面。
连锁：统一采购，统一配送、统一标识、统一营销策略、统一价格、统一核算加盟：有一家总部，提供货源。更新产品适应市场、提供指导和帮助。
旗舰店首先要搞清楚“旗舰”的含义。旗舰是一些国家的海军舰队司令、编队司令所驻的军舰，因舰上挂有司令旗，故叫“旗舰”。
旗舰店是竞争加剧的市场经济时代的产物，对促进连锁经营、树立品牌形象均大有益处，而且也是企业拓展市场份额的有效手段。
旗舰的英文翻译是ultimate,即终极的,根本的,极限的,最后的。在当今日趋激烈的竞争环境里，市场机会对于小资本的独立创业者来说已是越来越少。