只说主线吧。支线情节太杂，而且支线所涉及的种族及世界基本上都和旧帝国有关。
首先说一下，虚空的设定，是这个小说根基。可以想象一下，虚空是一片大海，位面是漂浮在海中的肥皂泡。宇宙（或者称为世界）包含于位面之中，一个位面可以只拥有一个宇宙，也可以拥有复数个宇宙，同一个位面之中的宇宙由以太隔开，世界之间通过以太向其他世界投影信息，以某种形式表现出来（动漫或游戏等），这是小说内各种动漫人物乱入的根源。
虚空有着无限的可能性，包括产生世界，毁灭世界，甚至直接产生生命（虚空生物）。最后这个是概率最低的，贯穿整本书也只提到了五个虚空生物，包括男主角。
接下来说的可以说是整本书围绕的核心。简单的说来，就是虚空拥有正负两面，男主角所处的可以认为是正面，虚空中什么都没有时，正负两面都记为0，虚空正面产生世界则正面数值+1，负面则会-1，久而久之，正负两面的数值相差越来越大，比如一面负无穷，另一面正无穷，极端的不平衡会使得虚空强行将正负两面的世界全部抹除，以达到归零的目的，然后重新产生世界，如此轮回，这种毁灭性的灾难被称为虚空大灾变，整个过程中只有虚空生物能存活下来。但是有一种方法可以缓解虚空大灾变，使得凡是与虚空生物挂钩的世界都可以存活，就是将正负两侧的虚空连接起来，可以想象成在咸水湖和淡水湖之间挖个沟，两个湖的浓度就会平均下来，这个被称为“架桥”。架桥需要两样东西。第一样是地基，需要合适的世界，可以通过毁灭目标世界周围的大量世界使得目标世界及其周围的虚空呈现稳定状态来达成。第二样则是桥墩，毁灭大量的世界并提取其中的世界之心（可以理解为信息集合体），将大量的世界之心融合到一起即可。二者都是旷日持久的工程。
另外，还有一个重要的概念，深渊。虚空在产生世界的同时会毁灭世界，深渊就是世界毁灭的过程中产生的现象，可以理解为房屋着火时的燃烧现象。并且在想到达另一侧的虚空就必须跨越高浓度的深渊，正面虚空的生物跨越上图的黄色界限之后会免疫负面的深渊，反之亦然。上图只是方便理解。
而被深渊感染的东西有两种结局，第一种是毁灭，这种毁灭极为疯狂，不光是毁灭自己，同时也会毁灭周围之物。第二种则是被同化，第二种分为多种情况。我给你列了个表，大致情况就在下面。
举个直白的例子，被火烧的人要么被烧死，要么没被烧死反而获得了火焰异能，虚空能量可以强制将快被烧死的人变为拥有火焰异能的人。深层净化和浅层净化的区别在于浅层净化的人在处理问题时更容易走极端，比如制造桥墩时，可以通过神族的能力制造无生命世界提取世界之心，但是浅层净化的深渊帝国会选择直接毁灭现有的世界来完成。
整本书的开端是一次失败的架桥。
虚空负面的种族意图以一己之力完成架桥，虽然将桥墩发送到了正面，但是没有两边合作失败是必然的，导致了架桥的失败。而虚空正面的桥墩所在的宇宙就是希灵族所在的宇宙，架桥所张开的深渊之门改变了整个宇宙的环境。使得希灵族背井离乡，并陷入被深渊感染物追杀的境地。希灵的先祖在关键时刻创造了希灵使徒，将整个种族的文化及各种资源交给了希灵使徒来传承。
希灵使徒由于是人为创造出来的，因而极端理性，存在的一切意义都是为了与深渊对抗，最终形成了阶级分明的体制，由135位地位平等的皇帝领导，每位皇帝分别统领由大量宇宙构成的一片天区。经过数不尽的时光，希灵使徒成为了唯一一个以凡人种族身份踏足神的领域的种族，并和神族结下了深厚的友谊。
由于种族的强大，希灵使徒将星域神族的领袖——父神的忠告弃置一旁，执意研究虚空，妄图人工制造虚空，结果却制造出了高浓度的深渊。由于希灵使徒所有人都挂在精神网络中，导致了一场覆盖全族的灾难。
希灵使徒中有几位重要人物要说一下。分别是奥卡姆，维斯卡以及深渊希灵。
奥卡姆是整个帝国中为数不多研究架桥相关事项的科学家，但也仅仅是研究了深潜船项目，即研究如何通过虚空之间的高浓度深渊到达对岸。
维斯卡则是希灵帝国在重生技术不成熟的情况下，进行的相关实验的牺牲品。以希灵将军潘多拉为原型制造了大量在潘多拉死亡后可用于替换的身体，这项研究被称为不灭者计划。因一次意外，大量储存潘多拉躯壳的要塞被深渊入侵，因潘多拉受到重创，一度与精神网络断开联系，导致所有的备用躯壳都被启动，为了确保潘多拉的唯一性，所有的躯壳开始了厮杀，最终只剩下一个，就是维斯卡。最终维斯卡陷入疯狂状态，并创立了自己的军团在各个宇宙间大肆破坏。
而深渊希灵则是希灵帝国精神网络的集群意识，在帝国实验失败前夕便开始准备各项措施为帝国谋求后路。并在帝国受深渊冲击后由于虚空生物的浅层净化而成为深渊希灵，将剩余的深渊使徒整合成了深渊帝国。为架桥做出了巨大的贡献。
图片里还有一个忘了说了，十五天区在概念割裂后就陷入了沉睡，直到主角的转生成人后，才开始了慢慢苏醒，并开始慢慢定位主角所在宇宙的位置，这就是为什么一开始主角会做关于母星的梦。
为了方便你理解，我建议你把这几章看一下。
《第六百二十九章 坟》及往后的几章，这是对皇帝们在被侵蚀后所做的事的解释
《第八百三十一章 古老的亡灵们》这几章介绍了几个皇帝在深渊化之后干的事
《第一千一百零二章 重磅炸弹限量加强周年纪念版》这几章讲了概念割裂的事
《第一千五百零七章 希灵意志》这几章解释了深渊希灵的大业
主角与母星建立了联系后，因为虚空生物强大的扰动性，即事件会主动找上门的体质，主角慢慢接触到了帝国沉睡的真相，并因为虚空生物的特质带领帝国走上了成神的道路。希灵帝国以前被称为半个神族，就是因为他们没有虚空生物的领导，空有力量，却没有神格。
基本上本书除了解释为何帝国会崩溃及帝国的来源，剩下的都是在阻止深渊帝国的大业，因为深渊帝国采取了比较激进的架桥方法，毁灭了很多世界。不过主角他们包括父神在内，中期才开始探索深渊，直到后期才知道并开始忙着架桥。结局是新帝国和神族还有深渊帝国以及虚空对岸的新种族开展合作，成功的架好了桥。
追问非常详细，感谢您的帮助，50分奉上
非常详细，感谢您的帮助，50分奉上
本回答被提问者和网友采纳正值远瞳起点封神、《异常生物见闻录》动画、漫画开始制作之际，越来越多的人开始接触远瞳的第一本书：《希灵帝国》。但由于这本书的前560章属于公认的黑历史，劝退能力惊人，因此远瞳也因此没少被喷——喷他的人有许多并不是杠精，他们只是被希灵的黑历史毒得不轻，没能看到希灵的史诗部分，这就导致希灵真正的粉丝们很难受……
我见过好些看了《黎明》和《异常》，感觉不错，然后去看《希灵》，结果心态瞬间爆炸的读者……嗯，这不是你们的错，《希灵》是眼珠子的新手作品，它的开头基本能劝退起点40％以上的读者。能一口气看完《希灵》全文的只有两种人：要么是真的坚韧不拔，要么就是看《希灵》之前没看过比它的开头文笔更好的书(比如我)……因此，我写了个阅读指南，希望没看过《希灵》的读者们不要错过这本好书
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先说人称的问题：第一人称并不是毒点，第一人称写得差才是毒点，咱高考阅读理解答案怎么说的？1.第一人称容易拉近与读者距离，使读者进入‘我’这个角色；2.便于抒发情感，进行详细心理描写；3.使文章更具真实性，故事性（曲折性或波折性），更生动形象，使读者能更具体的体会作者心情；4.通过对“我”的详细描写，来唤醒读者内心的感受和思考；5.使故事情节叙述杂而不乱，情感更加动人。对吧……(#滑稽)
只不过起点上很多第一人称的网文写的都不太好，就给了大家一个下意识的概念：第一人称的书都要不得。——我发誓：《希灵》（600章后）的第一人称绝对是起点最好的第一人称小说之一，能与其媲美的第一人称小说两只手都能数得过来。第一人称不是毒点，文笔差才是。
《希灵》的前560章左右是最具争议的。
第1到第159章，建议大家尽量不要看——我自己重看《希灵》的时候也不看的。这一段是眼珠子完完全全的新手期，说的难听点，那就是剧情低级文笔差劲，连里面出现的一个[奥铁]的设定，都在后期因确定与主设定(虚空阶梯)冲突而被删除。大家只要看百度百科把里面的人物背景设定看一遍就行。需要提及的剧情只有：主角陈俊遇到了一个从天而降的帝国，成了帝国皇帝，没了，剩下的**打脸拯救世界之流基本没有阅读的价值。（不过里面还出现过一个千章巨坑：第25章附近提到了数千年前有一名希灵使徒来到地球，然后因不明原因死掉了——这个死因直到第1301章才被重新提起）
第160到274章，眼珠子写的是艾泽拉斯同人。这一段（尤其是218章之后的部分）如果有兴趣的话倒可以看看，因为这段的剧情设计可以算是眼珠子前期的超常发挥。不过这段的文笔还是没有达到起点的平均水平，看不下去的话果断跳过，不要坚持。本段，一个反派群体：【堕落使徒】出现了。另外在这一段眼珠子添加了两个新的主要角色：维斯卡和莉莉娜。其中第232到234章建议稍微看一下，尽量不要跳过，因为它提到了维斯卡的诞生过程，这是维斯卡在数万至数百万年前异常行为的原因——反正就三章，扛过去不难……
第275至328章，一段在地球上**打脸的剧情，我第一次看的时候看的贼爽，看完全书之后重看的时候被毒的不轻……这一段的大多数章节建议你们别看，可能会瞎……主要的剧情是一群自称“奥林匹斯”的中二少年挖出了七十多万年前的帝国遗产，然后用这些不可燃垃圾催化出了一群超级异能者，于是感觉命途多舛准备征服世界遂被主角带人横扫。写这一段时眼珠子的文笔产生了一定的倒退。不过这一段倒是有几个章节可以看一下，毒的不是太严重：第275到277章，首次提到了叮当的世界管理终端：【世界之树】（该装置在全书中有重要作用）并为莉莉娜成为生命女神教的教宗作了铺垫；第283到285章，陈俊麾下出现了一个新的兵种：【装甲蝎】，并增添了一个重要角色：装甲蝎指挥官，维嘉。
第329到335章，还是奥林匹斯事件的后续，我之所以把它单独摘出来是因为到这一段我们已经越过了奥林匹斯剧情的主要毒点，这一段读起来没有太大压力，但这一段对后续剧情其重要作用。在这一段，首次提及希灵使徒特殊的战略级武器【荣耀级星球战舰】，我们在此见到了维斯卡的荣耀：【维斯卡壁垒星】并遭遇了一个千章巨坑：维斯卡壁垒星星环失踪之谜，这个坑到第1584章才填上。为防止剧透，更详细的东西我就不说了。这一段建议大家千万不要跳过。
第336和337章是日常，跟主线没啥关系，看不看随你
第338到第348章，一段原创剧情，主角们拯救一个爆发了丧尸危机的世界，灾难原因是一个砸在那个地球上的星环碎片——没错，就是一个自然段前我说的那个星环。本段把星环失踪之坑挖的更深了，但——是的，距离填上这个坑还差一千两百多章……我感觉这一段写的也就那样了，看不下去就跳吧，反正这半个自然段也已经把那十章的内容概括的差不多了……
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以上是《希灵》的黑历史时期，基本没有太多值得看的东西。
接下来我们将进入《希灵》的综漫时期，也是《希灵》在早期位列三大宅文之一的原因。有许多人不喜欢综漫，有的是讨厌综漫在各个作品中做世界观对比，有人是认为这是一种侵权行为（所以瞳叔才在吐血做希灵重制版啊……），有人则是单纯对二次元不感兴趣，反正他们不愿意看《希灵》的综漫部分——对于这种读者，我的意思是人各有志勿强求，看不下去就别看，从百度贴吧或本帖处了解一下大致剧情就好，不喜欢的跳过去，看后面的部分，肯定有你们喜欢的。
另外顺便说一句，我是被希灵带进二次元圈的，在这之前我根本没接触过二次元。至于我自己，我挺喜欢希灵的综漫剧情的，虽然侵权确实是个问题（瞳叔吐血中……），不过《希灵》的同人宗旨是“扭转所有的悲剧结局，反正有帝国后台最硬”，因此希灵的同人部分还是不错的。
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第349到第401章是《魔法禁书目录》的同人。从这里开始，眼珠子的剧情设计和文笔水平都拥有了超过起点全站小说平均线的水准，假如你们不是那么排斥综漫，最好不要跳过这一段。如果实在不想看，我来给你们说一下这里的重点剧情：希尔维亚：原创重要角色，在第362、368、369、372、378章及此后后大量主线剧情中出场，本体为希灵使徒，即曾艾泽拉斯剧情中出现的堕落使徒“贝拉维拉”，因不明原因失去力量和记忆并流落魔禁世界，其他剧情为防剧透暂时保密；佐天泪子：非原创次要角色，第722章后不再出场，在第359章末意外获得希灵使徒兵种【风暴指挥官】的能力（注：曾有大批伪希灵粉在B站魔禁视频佐天泪子出场处大量刷弹幕“参见风暴指挥官”，导致《希灵》严重被黑）；一万御坂妹妹：非原创次要角色，长期出场，在本段中，为保护御坂妹妹们，主角们将御坂妹妹们接到了影子城中生活，并在城中为她们建造了一个以学园都市为蓝本的“学园区”，这即是【帝国军事学院】的起源。
第402、403、404章为日常章节
第405到432章为《星际争霸》同人，这一段的文笔尚好，但剧情设定有一定的失常，建议跳过。本段主线剧情就是帝国来克普鲁星区消灭虫族这一危险种族，然后人族和星灵被一种被称作“启示”的神秘现象蛊惑，误认为帝国是侵略者。其实一点意思都没有，我有个同学就是在这个快要熬到头的地方弃的坑你说难受不难受……所以看到这还是跳过去吧……
第440到445章是星际同人的后续，不过和原作剧情已无太大联系（因为原作不可能出现一个黑天体，也不会乱入一个堕落使徒的君临者飞船），读起来压力不大。从这一段起《希灵》正式开始对“法则”、“宇宙规律”这类问题进行描写。本段值得一看，尽量不要跳过。
第446章为日常章节，勿跳
第447到第469章，原创剧情。文笔不错，剧情挺好，楼主强烈不赞成跳过本段，本段的大致剧情是帝国拯救一个已被毁灭的宇宙残片中幸存者的故事，这个宇宙残片后来被帝国改装成一台战略性法则武器【离世庭园】。在本段中，堕落使徒毁灭世界的主要目的之一被提及，并且帝国与星域神族恢复接触。两名来自神族的主要角色：依尔森与莫妮娜首次出现。
第470到512章，《Fate/stay night》同人。其实写的很不错，不过如果不喜欢的话跳过也可以。不过注意一点——第507章之后的部分不要跳过，这里提及了一个【红月】，这是原作所没有的设定，507章后主要就是陈俊冒险进入红月获取数据库（又称红月立方体）的剧情。红月是旧帝国沉睡之前最后的造物之一，其数据库记录了旧帝国末期研发的大量末日科技，这些禁忌科技对后期的剧情发展起到了重要的推动作用。本段其他的重要剧情为：帝国拯救世界完成后，FATE世界有一批英灵在经由叮当与当地两大抑制力交涉后编入新帝国阵营。
第514到517章，主要为日常及对红月数据库的分析情节，但由于其中有一个有关主要角色林雪的非常大的信息量，因此千万不要错过。（注：关于林雪这个角色，在黑历史时期眼珠子对她的描写有一点失误，因此跳着看的读者可能会感觉别扭——但这个问题我也不知道怎么解决你说该怎么办……）
第518章到537章，半综漫半原创剧情——大穿越潮。字面意思，大量来自异世界的人士因某种不稳定的跨世界现象（怀疑是某种虚空灾害或与堕落使徒有关，但该问题似乎被眼珠子遗忘了，直到完结也没提过穿越潮的发生原因）而穿越到首府世界（即主角生活的那个地球所处的宇宙）。这一段的文笔已经接近了高端水平，而且剧情非常欢乐，很不建议跳过——至少可以看着乐呵乐呵对吧。本次穿越潮是影子城“诸界之都”地位的基础，原本冷清的影子城从此热闹起来。另外提一下：斯巴达那两三章我看着有点尬的慌，你们想跳就跳吧，反正两章不碍事。
538到553章，《学园默示录》同人。本段的文笔不错，但前期的剧情着实没太大意思，如果不太喜欢的话不如从542或544章开始看——这后面的必须看，有一名重要角色上场：冰蒂斯。同时陈俊启用自己的新技能【虚空形态】，为下文前往星域神界时父神告知陈俊关于其身份的真相做铺垫。
554到567章，日常，勿跳
从接下来的大星云世界开始，是《希灵》公认的史诗期，接下来的每一章都不要跳过——你或许可以翻页翻得快一点，但千万不要跳过
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568到633章，原创剧情：大星云。瞳叔建立了一个极其宏伟的世界观，这是史诗的开端——尤其是第612章之后，我在《希灵》中第一次见到让我寒毛炸起的文字。
634到691章，半原创剧情：狂欢节。这是《希灵》全书我笑的最放肆的段落，我爸好几次问我是不是疯了……这一段一定要看——为了自己的心情。
692到715章，《东方project》同人+原创剧情：亚特兰蒂斯。上文329到335章曾提到过亚特兰蒂斯，大多数人都认为亚特兰蒂斯人已灭绝，但事实上有一批幸存者。亚特兰蒂斯人虽然是凡人，但他们几乎完美地继承了希灵使徒的精神，值得一看
716到726章，日常，勿跳
726到751章，访问星域神界，从这里开始，《希灵》再也没有需要解说才能阅读的章节，剩下的，都是史诗——通俗版的史诗。假如不是前面的新手期拖累了眼珠子，封神哪还要等到《异常》完结啊……这一本书就能让他位列起点大神行列了……