公费医疗和医保的区别有适用人群有区别、保障范围有区别、报销比例有区别、负担主体有区别、概念有区别，具体如下：
1.适用人群有区别：公费医疗适用人群一般仅限于公务员等国家工作人员；医保覆盖人群则包括了普通职工、城乡居民等；
2.保障范围有区别：公费医疗的保障范围相对医保来说要更大，报销比例也要更高一些；
3.报销比例有区别：医保一般是按照国家省市规定报销比例制定；公费医疗则一般是由单位出钱，可以报销全部；
4.负担主体有区别：公费医疗一般是由用人单位负担，纳入本部门预算；医保则一般是由社保基金进行支付，享受医保的通常都是企业职工和被剥离的原事业单位职工；
5.概念有区别：公费医疗是国家为保障国家工作人员而实行的、通过医疗卫生部门按规定向享受人员提供免费医疗及预防服务的一项社保制度；医保则是指社保中的基本医保，包括城镇职工医保、城乡居民医保、灵活就业医保。基本医保是国家和社会根据一定的法律法规，为向参保人提供患病时基本医疗需求保障而建立的社会保险制度。