呼吸内科作为国家级重点学科，在突发性重大呼吸系统传染病、支气管哮喘与慢性咳嗽、慢性阻塞性肺疾病、支气管肺癌等呼吸系统疾病的研究和临床诊治方面处于全国领先，达到国际先进水平。
省重点学科胸外科在肺癌治疗、肺移植等方面处于全国领先水平。重症医学科（英东广州重症监护医学中心）是华南地区最具现代化的中心ICU，其重症监护医学水平国内领先。
省重点学科泌尿外科以微创外科技术为特色，成立了全国首个微创外科中心，该中心目前已是国内规模最大，设备齐全，技术先进的微创外科中心，并成为全国腔内泌尿外科和腹腔镜外科人才的重要培养基地。2007年，坐落在该中心的全国内镜诊疗技术培训基地落成，拥有泌尿外科、呼吸科、普外科、胸心外科、妇科等五类培训基地，2008年，国内首批内镜专业技术（呼吸科、泌尿科）考试中心也顺利落成，打造成为国内先进的内镜专业技术培训平台。
肿瘤血液中心是医院大力打造的又一品牌学科。整合多种高水平的先进诊疗手段对恶性肿瘤病人进行整合式诊疗，提高恶性肿瘤病人的治疗效果和生活质量。
作为高等医学院校附属医院，医院实行医、教、研有机相融、相互促进的方针，在教学、科研和学科建设上也取得了可喜成绩。现有国家级重点学科1个[内科学（呼吸系病）]、省重点学科6个（内科学、外科学、儿科学、临床检验诊断科、妇产科学、神经病学），国家重点实验室（呼吸疾病国家重点实验室）、广东省重点实验室（骨科矫形技术及植入材料重点实验室）、广州市重点实验室（广州市泌尿外科重点实验室）各1个。2001年以来，医院共主持国家“973”项目1项、“十五”攻关项目1项、“863”项目5项、国家自然科学基金项目17项，主持省部级项目112项，科研论文1604篇（国家级694篇，SCI收录28篇），全院共获各种科技奖励38项，其中国家科技进步二等奖1项、教育部科技进步一等奖1项、二等奖2项、省科技进步奖14项。
在2003年的“抗非”斗争中，以钟南山院士为首的广医一院医务人员主动承担广东省大部分最危重非典病人的抢救重任，创造了9个之“最”，为“抗非”做出了重大贡献，得到了世界卫生组织的高度评价。
在“仁爱为本，精诚为强”的核心价值观的引领下，医院积极探索人文医学道路，2006年被批准成立全国首家“医师人文医学执业技能培训基地”，同时，医院坚持以病人为中心，积极开展优质服务，不断提高服务质量，取得了一定的成绩，连续荣获文明医院、最佳服务单位、最佳服务单位标兵、文明单位标兵、广东省百家文明医院、全国卫生系统先进集体等多项荣誉称号，钟南山院士荣获了全国劳模和中国卫生系统的最高荣誉——白求恩奖章。在2006年广东省省情调查研究中心开展的“广东三级甲等医院服务满意度民意调查”中，我院得到了广大患者的高度认可，荣获广东三级甲等医院服务满意度第二的好成绩。
