原合肥联合大学 原合肥联合大学由中国科学技术大学、合肥工业大学、安徽大学等7所在肥高校联合于1980年创办，位于黄山路中段。时提议的校名有“安徽自立大学”、“星津大学”、“江淮大学”等等。因抗战时期有个“西南联大”，由清华、北大、南开三所大学合办而成，办学效果很好。校方认为这个也叫联大，体现联合办学的精神。1980年8月28日，正式定名为“合肥联合大学”。1980年10月11日，第一批新生开学典礼举行。合肥联大是中国第一所自费走读大学。
该校创办时设立董事会，时任合肥市委书记郑锐任董事长，时任安徽省人大常委会副主任、原中国科学技术大学副校长杨承宗任校长。办学之初，就试行一种与当时其他高校不同的办学形式，即“联办公助、适当收费、按社会需求设置专业、不包分配、择优推荐录用、后勤社会化”。首届招生357名，学制为四年制本科，设中文系、理工系、英语系。
1985年3月，安徽省和德国下萨克森州在友好省州关系的基础上，签订了共建合肥联合大学协议，使合肥联合大学成为德国下州援助中方重点建设的两所应用型高校之一。该校还为税务、金融、电力、烟草等系统定向培养了一批毕业生。 原合肥教育学院 原合肥教育学院由原合肥师范专科学校和原合肥市教师进修学校合并组成，于1981年成立，位于宁国路北段，占地面积64亩，是以培训中学教师和教育管理干部为主的成人高等院校，同时还承担安徽师范大学本科函授教育。1993年开始招收全日制普通专科学生，开设有汉语言文学、史地、生化、英语、体育、数学、物理、计算机、初等教育和应用电子等专业。1997年被合肥市人事局认定为“合肥市专业技术人员继续教育中心”，1998年被国家教育部批准为“中央师范教育补助专款”院校。 原合肥师范学校 原合肥师范学校始建于1952年，位于金寨路北段，1999年迁至经济技术开发区，校区占地面积180亩，系安徽省一类师范学校。
文革时期，该校曾下迁到淮北太和县，1971年重新恢复，曾于1958-1962、1978-1981年两度经国务院批准改为合肥师范专科学校。该校1989年成为国家新教学方案首批试点学校之一，1995年起承担“合肥地区小学教师培训中心”任务 。 2002年3月14日，经中华人民共和国教育部批准，原合肥联合大学、合肥教育学院和合肥师范学校三校进行合并，成立合肥学院。2009年，该校被安徽省批准为硕士点建设单位。
2009年底，中国教育部主持的新一轮本科教学工作水平评估正式启动，选择在该校进行试评估。2010年4月，合肥学院与中国科学技术大学签订“中国科学技术大学——合肥学院校际战略合作框架协议” 及“中国科学技术大学——合肥学院联合培养专业学位研究生协议”。
2010年6月23日，学院入选《国家中长期教育改革和发展规划纲要（2010-2020年）》提出的高等教育重大改革计划项目，成为国家首批承担“卓越工程师教育培养计划”的61所试点高校之一。2011年，该校获批为“服务国家特殊需求人才培养项目”培养硕士专业学位研究生试点工作单位。
2013年4月，合肥学院与中国科学院过程工程研究所签订全面合作协议 。6月，合肥学院水环境治理及污染控制院士专家工作站建立 。
2014年合肥学院被确定为安徽省高等教育振兴计划“地方应用型高水平大学建设”项目立项建设高校。
