首先，百丈怀海建立丛林，根据实际要求，改变了以前出家人不做体力活，不耕田种地的传统，提倡了“一日不做，一日不食”的丛林清规，规定僧人每天必学出坡即劳作。
其次，丛林建设的意义在于禅僧禅居方式的调整与变革，而禅居方式的变革并不仅仅表现为禅僧生活方式的改变，也涉及到僧团内部一系列制度的变更。象百丈禅师制定的《百丈清规》，以及后来逐渐形成能够的《禅门日诵》成为了不仅是禅寺还有律寺等总的行为准则和功课。 另外，马祖别立禅居与传统寺院有着很大的不同，但其大众共修、参禅悟道的宗旨却与传统寺院相同。这样脱离官寺控制所独创的禅林，就需要在传统戒律与僧制之外另行创立一套规范化的可以摄受僧众、安心修禅的制度，使修禅者有自己的规范可守。
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