根据教育部发布的第四轮生物医学工程学科评估结果可知，全国共有49所开设生物医学工程专业的大学参与了评估，其中排名前3的大学是东南大学（A+）、华中科技大学（A+）、上海交通大学（A），具体的排名情况如下：
1、东南大学（A+）
2、华中科技大学（A+）
3、上海交通大学（A）
4、清华大学（A-）
5、北京航空航天大学（A-）
6、浙江大学（A-）
7、四川大学（A-）
8、北京大学（B+）
9、天津大学（B+）
10、复旦大学（B+）
培养目标：
生物工程专业的培养目标是通过各种教育教学活动培养德、智、体、美全面发展，具有健全的人格，正确的世界观、人生观和价值观，具备良好的人文社科基础知识和人文修养。
具备生物学与工程学基本知识、掌握生物产品大规模制造的科学原理，熟悉生物加工过程流程与工程设计等基础理论和技能，能在生物工程领域从事设计、生产、管理和新技术研究、新产品开发的高素质专门人才。
参考总学分：一般要求：总学分=课程总学分（不少于140学分）+实践环节课程【军训+工程技术技能训练+认识实习与生产实习+科研训练+毕业设计（论文）（不少于25学分）】。
总学分不低于165学分，但不高于180学分，其中总的实践环节不少于25周。各高校根据办学实际也可对学分与学时进行适当调整。各课程的最少学时数或实验时间，各高校应考虑课堂讲授、网上学习、自学等不同学习形式的差别而制定。
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