从我的了解情况看，目前的人事档案管理分为两种情况。一种是本单位自己管理，主要是国家公务员、事业单位和国有大中型企业单位，一般都会设有专门的人事档案管理部门、组织部门，所以这些单位职工的档案都是放在本单位的；第二种情况是人才市场托管模式，主要是民营企业、未就业大学生，由于规模较小或者不具备保管人事、组织档案的资格或其他一些原因，一般会委托专业的档案管理机构进行管理。大中专毕业生，在没有找到合适的工作落档之前，也可以把档案存放在这类机构。通常情况下，这类机构是各省市人才市场的下设部门，因此大家通常说的“把档案放在了人才市场”。对组织档案而言，大中专学生毕业后，一般是和人事档案放在一起的。
我的档案属于第一种情况，有大中专学生的派遣证，单位同意接收，然后将组织档案和人事档案转来，就放在本单位。我的一个朋友在民企，他们单位人员的档案都是放在人才市场的。
对于你的第二个问题，农业户口与档案接收之间是不是有必然联系，我不是很清楚。一般来说，只要你有大中专学生毕业的派遣证，人才市场是不应该拒绝你的。因为在人才市场上托管档案，每年都要交给人才市场一定费用的。而且，我也没有听说国家规定人事档案必须是城市户籍的才可以放。
说个实话，只要你不从政，档案放在哪里都是一样的。有的人还自己拿着呢。如果你觉得自己拿着不放心，多走几个市县的档案管理中心，肯定可以放的。
另外。可以告诉你的是，现在农业户籍比非农业户籍更好，将来能够享受到的政策优惠应该多于城市户籍人口。如果是因为人才不接受档案，想转成非农业户籍的话，是完全没有必要的。
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