推理1：不知道楼主看过
生化危机没，看过就会感受到，当病毒的
感染者是人群的时候，就很难被完全消灭的，无法避免它的传播，因为人毕竟会到处乱跑，自己觉得可能没被感染，但是比如身上沾有病毒血液的话。。。那就。。。相当于一个半携带者。
推理2：那个小孩已经被感染了，但是就像他母亲一样，因为体内有某种抗体，所以不会发作，但是具备极强的传染性。这一点在前半部分美军的medical officer研究其母血样的时候交代过了。 但是，这个小孩的事情，只有那个女科学家知道，别人根本不知道他已经被感染了，可能刚刚带到法国之后那个飞行员和他姐姐就因为一些可以传播病毒的动作比如比较正常的抚摸什么的被感染了，然后病毒开始在法国蔓延。所以最后的一幕是
埃菲尔铁塔前的广场上，无数被感染的怪物在奔跑。
我个人倾向于第二个，一个是因为靠谱，另一个因为又28天后导演的第一个镜头给的是直升机，而且旁边有那个小孩的亲笔纸条，说明这肯定是那架运输他们到法国的直升机，但是直升机看起来那么旧，好像荒废了一样，没有任何保养，这是为什么呢？只能是它刚刚降落之后就被遗弃了，上面还有那个小孩和妈妈的合照。小孩如此看重和妈妈的合照却最后扔掉了！那么就是刚刚降落之后就出事了呗！
开放式结局，看你是怎么看待了。一千个读者就有一千个
哈姆雷特。
回答够详细了，楼主能多加点儿分儿么。。。