在交通运输行政主管部门会同市公安机关客运治安管理部门进行核查和考核。
根据《南京市网络预约出租汽车管理暂行办法》
第十条 拟从事网约车服务的驾驶员，由市交通运输行政主管部门会同市公安机关客运治安管理部门进行核查和考核。
符合条件且考核合格的驾驶员，由驾驶员或者网约车平台公司向市交通运输行政主管部门申请办理网约车驾驶员证。
网约车驾驶员证注册有效期为三年。
扩展资料：
南京市网络预约出租汽车管理暂行办法
第一章 总 则
第一条 为了更好地满足社会公众多样化出行需求，促进出租汽车行业和互联网融合发展，规范网络预约出租汽车经营服务行为，保障乘客安全和合法权益，根据有关法律、法规，制定本办法。
第二条 本市网络预约出租汽车（以下称网约车）经营服务和相关管理活动，适用本办法。
第三条 市人民政府积极推进互联网和经济社会融合发展，鼓励出租汽车经营服务创新，按照科学引导、多样化服务、差异化经营的原则，有序发展网约车。
第四条 市交通运输行政主管部门是本市网约车管理的行政主管部门，区交通运输行政主管部门按照规定的职责负责辖区内网约车监督管理工作。交通运输行政主管部门所属的运输管理机构负责网约车日常管理工作。
发展和改革、价格、通信、公安、商务、人力资源和社会保障、工商、税务、质量技术监督等行政主管部门，按照各自职责共同做好网约车管理工作。
第二章 经营条件
第五条 申请在本市从事网约车经营的网约车平台公司，应当符合国家相关规定，具备线上线下服务能力，拥有保障服务的营业场所、培训教育场所和相应数量的工程技术、投诉处理及运营管理服务方面的工作人员，未在本市注册的企业法人应当在本市设立分支机构。
第六条 市交通运输行政主管部门应当按照国家有关规定，对符合条件的网约车经营申请人，发放网约车经营许可证，并签订运营管理协议。网约车经营许可证有效期为四年。
运营管理协议包括经营范围、经营期限、经营管理、安全管理、信息管理、车辆人员管理、服务质量保障、线下服务能力要求、经营者承诺等内容。
参考资料来源：百度百科-南京市网络预约出租汽车管理暂行办法
1、可以直接在网上申请的。
2、首先先报名，符合条件后通知参加考试，考试合格后领取网约车驾驶员从业资格证。同时车辆也要办理运输证，三证齐全才可以上路。本回答被网友采纳