根据上述职责，市规划局机关设10个内设机构，均为正科级建制。
（一）办公室
负责局机关行政事务及各类会议的会务工作；负责拟订年度工作计划和工作总结；负责秘书事务、文电处理、档案管理、保密、信访、安全、保卫等工作；负责办理市人大建议、市政协提案以及局重大决定事项的督办工作；负责新闻宣传报道和规划信息的编撰；组织课题调研、外事接待；负责局财务管理、固定资产的计划与管理；指导和监督局系统的财务管理工作。
（二）总工室
负责规划编制任务的拟订、下达和资金管理；负责规划编制成果的审查和报批工作；负责规划设计方案竞选、竞赛和优秀规划设计评选的组织工作；负责拟订规划科研课题计划并实施管理；负责科技成果的评审报批；参与专业规划的编制；参与测绘、市政、村镇规划等规划审查；参与各类建设项目的技术审定；负责规划设计行业管理；指导县级市、区规划部门工作。
（三）用地规划管理处
参与专业规划的编制；负责规划区内建设项目的选址定点；审核《建设项目选址意见书》和《建设用地规划许可证》；负责城市国有土地使用权出让、转让的规划管理；招标拍卖地块及其性质的确定。
（四）村镇规划处
负责本行政区范围内村镇规划的指导、组织、管理、审核和监督工作。组织并指导城乡一体化规划和新农村规划；负责国家级、省级和市级历史文化名镇（村）保护规划的申报、审核及相应的管理工作；指导建制镇总体规划、镇村布局规划和村庄规划等编制工作；指导和监督各县级市、区实施城镇规划工作；组织乡镇干部有关规划业务培训工作。
（五）建设规划管理处
负责审核城市规划区内建设项目的修建性详细规划、建设工程设计方案；审核建设项目的《建设工程规划许可证》；组织实施建设项目的规划公示；负责建设项目的验线并实施跟踪管理；参与建设项目的规划核实；协助做好相关违法建设项目的查处认定工作。
（六）市政规划管理处
参与城市规划区综合交通规划及相关市政专项规划的编制；负责城市规划区内道路红线的划定；提出道路建设工程的规划设计条件并实施规划管理；负责对规划区内轨道、码头、桥梁、涵洞、各类地上、地下管线工程及其附属工程设施提出规划设计条件并实施规划管理；负责各类管线规划综合工作；负责空中微波、电信通道的规划工作；负责收集、提供城市道路工程管线资料；参与全市地下管线普查工作；参与供电、供水、防汛等相关专业规划的编制工作；参与相关建设工程的规划竣工验收；协助做好相关违法建设项目的查处工作。
（七）政策法规处
负责编制城乡规划地方性法规、规章的年度立法计划；参与制定城乡规划、村镇规划的法规、规章和实施办法；负责对规划区内城乡规划、村镇规划实施情况的监督检查；负责城乡规划行政执法监督检查；负责城乡规划、村镇规划行政案件的预审工作，代理行政处罚听证、行政复议、行政诉讼、行政赔偿和申请法院强制执行等工作；负责法制宣传和培训工作；组织协调相关执法部门开展有关规划监察执法工作；负责建设项目规划竣工验收。
（八）行政许可服务处
负责受理建设项目的报审工作；负责建设项目在局内处室的运转交接；负责报建项目资料的整理汇总、统计；负责报建项目面积、收费的核准工作；负责报建项目规范化运作；社会服务承诺制、行政管理公示制的督办工作；负责报建项目“一书三证”的“窗口”发放工作。市区的《乡村建设规划许可证》由所在规划分局审核、发放。
（九）信息处（规划测绘管理处）
负责本部门局域网的建设、维护和管理，确保网络及其设备的高效、安全、经济地运行；负责本部门网站的建设、日常维护管理以及“中国苏州”政府门户网站、市综合信息网有关栏目的维护和信息采集、提供工作；负责本部门电子政务应用系统及安全保障系统的开发、维护和管理；组织信息资源的开发、利用和管理工作，实现信息资源的有效共享；配合市政府信息主管部门做好信息化的宣传、教育和培训工作；负责城乡规划测绘和测绘成果的管理；组织实施地下管线普查；建立、维护和管理苏州市基础地理信息系统。
（十）组织人事处
承担局管理干部的培养、选拔、考察和领导班子建设的有关工作，指导本系统干部队伍建设；负责局机关并指导局属单位机构编制、干部人事、社会保障等管理工作；承担机关和局属单位人员出国（境）政审等管理工作；负责局党组中心组秘书工作；负责工青妇工作；开展思想政治工作研究；负责局离退休干部的服务管理工作。
另按有关规定设置派驻纪检组、监察室（合署办公）。
