军统，中统和保密局在成立时间，领导，全称和工作范围不一样。
1、成立时间不同
军统是1937年底成立，中统是1938年3月成立，保密局是1946年6月成立。
2、单位领导不一样。
军统主要负责人是戴笠，中统主要负责人是陈立夫、陈果夫兄弟，保密局主要负责人是毛人凤。
3、全称不一样
中统局全称中国国民党中央执行委员会调查统计局，简称中统。军统全称国民政府军事委员会调查统计局，简称军统。1946年3月，军统副局长戴笠坠机死亡，6月，蒋介石对该局进行改组，原军统局核心系统改组为以毛人凤为首的国防部保密局，简称保密局。
4、工作范围不一样
中统负责除军、宪、警等军事部门外的情报安全工作。中统的工作重心在党政机关内部，另一个重点就是暗中打击一切反对派政党，尤其是共产党。
军统负责军、宪、警部门以及对外的情报安全工作，军统也担负了一些诸如对行政机关、交通、金融等要害部门的监控。
保密局人员分布到国民党的军队、警察、行政机关、交通运输机构，乃至驻外使领馆，专门以监视、绑架、逮捕和暗杀等手段进行活动。
参考资料来源：
1、单位全称不一样。
军统全称是国民政府军事委员会调查统计局。
中统全称是中国国民党中央执行委员会调查统计局。
保密局全称是国民党保密局。
2、成立时间不一样。
军统成立时间是1937年底，前身力行社成立时间1932年。
中统成立时间是1938年3月，前身中央组织部党务调查科成立时间1928年。
保密局成立时间是1946年6月，由军统的秘密核心部分改组而成。
3、单位主要负责人不一样。
军统主要负责人是戴笠。
中统主要负责人是陈立夫、陈果夫兄弟。
保密局主要负责人是毛人凤。
4、职能有差异。
军统是国民政府军事委员会的情报机构。
中统是国民党中央的情报机构。
保密局与军统较类似，不过减少了公开特务武装部分。
5、具体从事的业务不一样。
军统业务分为两大块，一是专门以各种特务手段，进行反共活动。二是在抗日战争时期，制造针对日军的恐怖活动，对打击日本侵略和汉奸。
中统业务以党政机关、文化团体和大中学校为活动重点，特务活动遍及全国。他们网络党羽、特务的手段和对中国共产党的破坏活动无所不用其极。他们捕风捉影，乱抓乱捕，制造了许多冤狱。
保密局与军统相似，主要是以监视、逮捕、绑架和暗杀等手段，进行反共活动。
6、消亡时间不一样。
军统1946年改组后，秘密核心部分改组为保密局，公开武装特务部分划归国防部第二厅。
中统1947年-1949年改为党员通讯局，后改为改为国民政府内政部调查局。
保密局1949年迁台后，保密局恢复正式编组，于台北士林芝山岩设立局本部，设有情报学校训练间谍，持续执行情报蒐集，并主导台湾省工作委员会案及台北市工作委员会案等白色恐怖。
参考资料来源：百度百科—军统
参考资料来源：百度百科—中统
参考资料来源：百度百科—保密局（国民党）
本回答被网友采纳1947年中统局改名为党员通讯局，1949年改名为内政部调查局，习惯上仍称为CC或中统。内调局隶属于国民政府行政院内政部，事实上仍属蒋系中央掌控。
军统全称国民政府军事委员会调查统计局，简称军统。军统的成立基础是中华复兴社特务处。军统负责军、宪、警部门以及对外的情报安全工作（类似今天美国的CIA）。军统也担负了一些诸如对行政机关、交通、金融等要害部门的监控。
1946年3月，该局副局长戴笠坠机死亡，6月，蒋介石对该局进行改组。由军事委员会第二厅与军统局合并组成国防部二厅（国防部由军委改组而来），厅长郑介民。原军统局核心系统改组为以毛人凤为首的国防部保密局。本回答被提问者采纳