1、定义不同：生产成本是企业为生产商品和提供劳务等所发生的各种耗费和支出。主营业务成本是指企业确认销售商品、提供劳务等主营业务收入时应结转的成本。
2、核算内容不同：生产成本包括三个成本项目，即直接材料、直接人工和制造费用。在企业生产过程中实际消耗的直接材料、直接人工和制造费用，都应计入产品或劳务的生产成本。工业企业的主营业务成本就是"产品销售成本"，是从"产成品"、"自制半成品"、"分期收款发出商品"、"生产成本"等项目结转过来的。主营业务成本反映企业经营主要业务发生的实际成本。
3、科目类别不同：生产成本为成本类科目，主营业务成本为损益类科目，属于费用要素。
4、生产成本是核算全部的本年生产实际发生的各种成本，主营业务成本只是生产成本的一部分，是生产成本中相应的存货的销售已经实现的部分。