实际上，在中日之间长达1400余年的、有文字记录的交往历史中还有三次大规模战争。简述如下：
一、白江口大战（公元663年，唐高宗李治龙朔三年，日本天皇元智二年）
古日本（倭国）于五世纪初完成了国家统一。在中国隋代即有派遣“遣隋使”，当时的倭国对中国国力认识不足，国书抬头称“日出处天皇致日没处皇帝”等语，颇有分庭抗礼、平等外交之意。汉以后，今朝鲜半岛出现了三个国家，百济、高句丽结盟于倭国，新罗结盟于唐朝。前两者联合倭国攻击新罗，新罗向唐求援。
663年8月间以水战为主的白江口大战，经过四个回合，唐新联军以较少人数和战船数（170只，但吨位占优势），破百济及日本援军之千余战船（一说400多艘）。该战役后，唐还惩罚了高句丽，但未对倭国继续用兵。
第一次战争的意义：倭国重新认识到与中国的巨大差距，以极大的热情，在随后300多年的时间内派遣“遣唐使”，全面学习中国文明，经济贸易往来也十分平凡。倭从唐获得国名“日本”，日本在此期间纳入以唐帝国为中心的华夷朝贡体系，也就是加入了当时和平稳定的东方世界政治经济秩序。
二、元帝国及其高丽属国入侵日本之战争
战争初起时，东亚大陆正处于元帝国打击南宋帝国残余势力之时。铁木真的孙子忽必烈多次派遣使者要求日本无条件投降纳贡。日本年轻的统治者果断拒绝投降，还杀了元使。
大规模的战役有两次，发生于公元1274年、1281年、元朝至元十一年、十八年，日本天皇文永十一年，弘安四年。虽然日本军队战力不强，但元军不习水战，所用海战之舰船均系平底（只能用于内河），且元军民族政策十分残暴，军队内部思想不统一，其机动骑兵作战的优势完全无法发挥，且两次为台风袭击，最终损失惨重，对日本的侵略战争以失败告终。
意义：日本保持了独立；作为亚洲政治经济体系类的“另类”因素开始潜伏出现。
三、明帝国援助朝鲜抗击日本军阀丰臣秀吉之战
丰臣秀吉统一了战国时代的日本后，将自己的所有精力用于向亚洲大陆发动侵略战争。1592年他准备经朝鲜发动对中国的战争前夕，他认为自己将在两年内占领北京，并下达了准备迁都北京准备令，安排了战后日本、中国的人事任命；他还认为，占领北京后，他自己将定居宁波，指挥占领印度的战争。在朝鲜的陆地上，日本军队取得了成功，但朝鲜军队在海战中重创日本，随后增援的明朝军队联合朝鲜军队，收复了失地。中日双方开始了漫长的和平谈判。
但是，日本不接受中国在当时的国际关系中分配给它的配角地位，五年后的1597年日本重启侵略战端。结果陆军为明帝国所败，海军为朝鲜击败，次年丰臣秀吉抑郁而亡。
意义：日本企图告别独立，主导亚洲格局的努力失败，日本进入了260多年的闭关锁国时代，但日本的大陆扩张主义作为其民族性的内核，第一次明确地保存下来直到第四次中日战争，乃至当代；中国也未能将日本纳入已经长期存在于亚洲的华夷体系。
后边的中日甲午之战，日本侵华战争，想必大家都知道。
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