一、夏、商、春秋、战国时期
九江境地在夏、商时期分属荆州、扬州。春秋时期，属吴国和楚国，有“吴头楚尾”之称。战国时期，九江境地历经多次变更：周元王三年（前473年），越国灭吴后，九江隶属越国；周显王三十五年（前334年），楚国击败越国，九江隶属楚国。商代设有艾侯国，都城位于修河上游，涵盖修水、铜鼓、武宁、永修等地。武王克商后，设立艾监。春秋后期至战国期间，出现了县邑，江西境内有番、艾两邑，艾邑辖区大致与艾侯国、艾监相等。
二、三国、两晋、南北朝
三国时期，九江属于孙吴，柴桑隶属武昌郡，寻阳隶属庐江郡。各县分属武昌（柴桑）、豫章（艾、海昏、建昌、永修、新吴、西安、彭泽）、鄱阳（鄡阳、历陵）、庐江（寻阳）四郡。西晋太康元年（280年），将西安县改为豫章县。元康元年（291年），分扬州之豫章、鄱阳、庐陵、临川、南康、建安、晋安，荆州之武昌、桂阳、安成十郡为江州，治所位于豫章（今南昌）。永兴元年（304年），分庐江郡寻阳县、武昌郡柴桑县合设寻阳郡，治所位于寻阳县（江北），属江州。东晋咸和年间（326-334年），先后将寻阳郡治、寻阳县治由江北迁至柴桑；咸康六年（340年），江州州治由豫章移驻寻阳。至此，州、郡、县三级政权同治寻阳。义熙八年（412年），寻阳郡改名为江州郡；省去寻阳县，并入柴桑。南朝宋永初二年（421年），废去鄡阳，并入彭泽县。元嘉元年（424年），废去历陵，并入柴桑县；二年（425年），废去海昏，并入建昌县。
三、明、清朝
明朝洪武初三年（1370年），降建昌州、宁州为县；九年（1376年），改江西行省为江西等处承宣布政使司，全省分为五道、十三府，其中九江道辖九雀瞎迟江、南康、饶州三府；九江府辖德化、德安、瑞昌、湖口、彭泽五县。清代，九江境内各县隶属仍承袭明制。嘉庆六年（1801年），改宁州为义宁州。咸丰四年（1854年），太平军改湖口为九江郡，以九江府为江西省；太平天国失利后，清复原制。
四、中华民国
辛亥革命后，废除府制。1912年改义宁州为义宁县。1914年，全省设四道，辖81县，其中浔阳道辖20县。同年，为避免道、县同名，改德化为九江县、义宁为修水县、建昌为永修县。1926年废道，各县均直属省政府。1927年设九江市政厅，次年改称市政府，1930年撤销，并入九江县。1932年以后，江西省设行政督察区，其区划变更频繁，数量时有增减。以1935年全省设八个行政督察区，今九江境内各县隶属关系为：武宁、修水、永修属第一行政督察区；都昌、彭泽、湖口、九江、星子、德安、瑞昌属第五行政督察区。九江在民国以前，商业发达，几度繁华，曾为富庶之地。
五、中华人民共和国
1949年5月7日九江解放，7月19日设九江专员公署，析九江县城厢设九江市。1968年4月，成立九江专区革命委员会。1971年2月，改为九江地区革命委员会，1979年改为九江地区行政公署。1980年九江市从九江地区划出，升为省辖市，辖浔阳区、庐山区、郊区三区。1983年7月27日地市合并，同时实行市管县体制，辖浔阳区、庐山区、九江县、武宁县、修水县、都昌县、彭泽县、湖口县、星子县、德安县、永修县、瑞昌县。1989年12月，经国务院批准，瑞昌县撤县设市，设立县级瑞昌市，由九江市代管。2010年9月，经国务院批准同意，设立县级共青城市，由九江市代管。2016年5月，经国务院批准同意，撤销星子县，设立县级庐山市，由九江市代管。同时将庐山区牯岭镇划归庐山市管辖。以原星子县和庐山区牯岭镇的行政区域为庐山市的行政区域。原来的庐山区更名为濂溪区。将驻濂溪区赛阳镇的庐山云雾茶场（含剪刀峡景区入口）、庐山茶科所，驻莲花镇的莲花林场，驻海会镇庐山茶场管理范围划入庐山市牯岭镇管辖。2017年8月21日，经国务院同意，国函〔2017〕104号文件已同意撤销九江县，设立九江市柴桑区，以原九江县的行政区域为柴桑区的行政区域，柴桑区人民政府驻沙河街镇庐山北路168号。
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