如果发现从马桶飞出小虫子，应该采取以下措施：
1.检查马桶是否清洁：如果马桶长时间不清洁，清洁不彻底，就容易滋生细菌和小虫子。可以使用专业的厕所清洁剂，彻底清洁马桶、管道、水箱等部位。
2.加强卫生习惯：每天重复清洗除臭盖和马桶四周，及时清理毛巾、浴巾、马桶刷等不干净和有异味的物品。定期更换厕纸和牙刷。
3.使用杀虫剂：如果小虫子已经大量滋生，可以使用专业的杀虫剂，喷洒在污水管道、下水道、厕所等处，杀灭小虫子。
4.彻底清洁管道：如果发现小虫子从马桶飞出，可能是因为管道清洁不彻底，可以使用专业的管道清洁剂，清洁下水管道，让水流畅通。
总之，加强卫生习惯和及时清洁马桶是预防小虫子的最有效方法，一旦发现小虫子，立即采取措施，避免滋生和繁殖，保持卫生。