山东财经大学比较好。
1、从地理位置上看
明显山东财经大学占据优势，位于省会济南，虽然吸引力不及省内青岛，但是终究是个省会；而安徽财经大学位于蚌埠，在安徽经济排名也相对靠后，地理位置是个相对劣势，不过好在蚌埠是交通枢纽，还是比较方便的。
2、从学校历史上看
山东财经大学：创建于1952年，时名山东财经学院，1978年恢复办学并更名为山东经济学院，2011年教育部同意山东经济学院与山东财政学院合并筹建山东财经大学，2012年3月2日，教育部正式公示山东财经大学“去筹”成功。
安徽财经大学：创建于1959年，时名安徽财贸学院，后1961年搬至蚌埠，1965年学校划转中华全国供销合作总社主管，更名为安徽商学院。文革期间，学校先后更名为安徽省财经学校、安徽省供销商业学校，1992年9月，安徽财贸学院、安徽商业管理干部学院重组成新的安徽财贸学院，学校先后隶属于中华全国供销合作总社、商业部、国内贸易部，2004年更名安徽财经大学。
3、从学科专业设置看
山东财经大学：学校以经济学和管理学科为主，兼有文学、法学、理学、工学、教育学、艺术学八大学科门类，设有23个教学院（部），61个本科专业；10个一级学科硕士学位授权点，73个二级学科硕士学位授权点，14个专业学位授权点；3个一级学科博士学位授权点，15个二级学科博士学位授权点。
安徽财经大学：是一所以经、管、法学为主，跨文学、理学、工学、史学、艺术学八大学科门类的多学科性高等财经院校。现设有12个学院，1个教学部，29个校级研究机构，62个本科专业；8个一级学科硕士学位授权点，39个二级学科硕士学位授权点，13个专业硕士学位授权点。
4、从师资力量上看
山东财经大学：有专任教师1865人，其中教授、副教授989人，教师中有国家级有突出贡献的专家3人，享受国务院政府特殊津贴的专家16人，“泰山学者”岗位8个。
安徽财经大学：有专任教师994人，具有高级职称教师453人，国务院特殊津贴专家和省政府特殊津贴专家18，全国优秀教师4人。