2004年，撤销桐君街道湾里村、施家村、范家边村、金山村、儒闾村、周家村、江头村、江联村、青山村、下城村、三联村、中联村、乌枫塘村、峙山村、大元村、大塘村、童家村、岩下村、蒋陆家村、高荷村、尹家村、大脉村、徐溪村、石珠村、仁智村、天井坞村、西坞村、阆苑村、阆里村、高山村、岩桥村、桥外村、麻蓬村、仇岭坞村、坞泥口村、梓芳坞村、马家村、滩头村，新建湾里村、金联村、春江村、金中村、金溪村、金牛村、东兴村、金东村、仁智村、阆苑村、岩桥村、麻蓬村、君山村、滩头村。
2004年，撤销旧县街道旧县村、上联村、四联村、上峰村、鸿儒村、大山湾村、合岭村、尹峰村，新建旧县村、鸿儒村、合岭村。
2004年，撤销分水镇白沙村、东关村、玉泉村、县东村、县西村、梧桐村、西关村、天英村、新民村、塘源村、民建村、洪坑村、虹桥坞村、里湖村、里邵村、刘家村、张村村、大路村、桥东村、周王坞村、东溪村、柏山村、石家村、张家村、马源村、龙潭村、大张村、臧家边村、保安村、潘家村、丰收村、义林村、塔联村、陈家村、松田村、盛村村、延村村、太平村、章家村、高联村、双坑村、外范村、高塘村、百联村、定联村、建设村、西华村、贺州村、富家村、老坞村、张家坞村、印渚村、法道村、南堡村，新建武盛村、城西村、天英村、塘源村、里湖村、大路村、桥东村、东溪村、三合村、新龙村、保安村、小源村、盛村村、太平村、高联村、外范村、百岁坊村、三槐村、富源村。
2004年，撤销江南镇青源村、西坞村、合联村、环溪村、屏源村、黄程村、深澳村、石联村、石合村、石丰村、石五村、石阜村、珠山王家村、珠山俞家村、珠山吴家村、珠山奚家村、乳泉村、坞聪村、彰坞村、新庄村、小潘村、双义村、板桥村、邓家村、严坞村、蒋坞村、姚家村、枝茂村、满林村、会山村、五联村、赵家村、黄家村、窄溪村、陈庄村、沈家村、前村村、古城村、舒湾村、棠川村，新建青源村、环溪村、深澳村、石阜村、珠山村、彰坞村、小潘村、凤鸣村、金茂村、锦江村、窄溪村、舒川村。
2004年，撤销凤川镇肖岭村、雷坞村、竹桐坞村、凤岗村、凤新村、凤镇村、石桥村、梅山村、凤龙村、上喻村、旺家弄村、上店村、凤源村、高家村、中巡村、黄场坞村、松香坞村、桃岭村、西毛村、东毛村、甘竹村、华家塘村，新建三鑫村、翙岗村、园林村、外源村、潇源村、大源村。
2004年，撤销富春江镇俞家村、俞赵村、秀峰村、新江村、芝厦村、溪南村、大竹垅村、芦茨村、蟹坑口村、双源村、里董村、梓坞村、小庄村、孝门村、石塘村、外董村、蒋家埠村、沙湾村、祝家村、邵家村，新建俞赵村、芝厦村、芦茨村、里董村、孝门村、严陵村、七里泷村。
2004年，撤销百江镇杨村村、联盟村、百江村、广王村、冯家村、朱门村、苎麻村、松村村、后坞村、钱家村、东辉村、塔岭村、小京口村、小京村、六坑村，新建联盟村、百江村、松村村、钱家村、东辉村、小京村。
2004年，撤销瑶琳镇翠屏村、潘联村、皇甫村、和平村、姚村村、沈村村、洞前村、大方村、蒋家村、桃源村、东华村、冷坞村、吴家村、杨家村、东洲村、上沈村、文源村、毕浦村、糁源村、方吴村、上王家村、方家村、何宋村、潘村村、范家村、王家村、坞口村、全坞村、严村村、金竹岭村、后浦村、大庙村、石青村、高翔村、沙潭村、王家岭村、桐岭村、珠村村、童家坞村、玉柱村，新建潘联村、皇甫村、姚村村、桃源村、东琳村、文源村、毕浦村、永安村、何宋村、百岁村、后浦村、高翔村、琴溪村。
2004年，撤销横村镇双湖村、徐家埠村、横村村、深畈村、富乐村、里濮村、外濮村、葛家村、庙下村、大塘头村、小外塘村、外元村、里元村、大畈村、半山村、上浦村、唐王岭村、后岭村、元丰村、仓里村、里村村、陈家山村、下张村、宋家村、船形岭村、凤山村、华樟坞村、淡竹山村、罗溪村、新义村、柴家边村、里柴村、联峰村、十字路口村、石青桥村、郑城村、大会山村、峰坞村，新建城东村、横村村、九岭村、东南村、元村村、上塘村、后岭村、凤联村、华凤村、双溪村、胜峰村、白云村。
2004年，撤销合村乡陈村村、后柏村、前柏村、大琅村、合村村、麻境村、合强村、支援村、金星村、琅玕村、大溪村、牛水坞村、岭源村、小茆坞村、诸家村、黄山村、茆源村、三合村、岳山村，新建后溪村、合村村、高凉亭村、岭源村、三源村、瑶溪村。
2004年，撤销钟山乡中一村、青南山村、下邵村、吴宅村、包家山村、城下村、骆家村、珠边畈村、大市村、龙家山村、长丘田村、赖田坞村、新村村、富村村、潘畈村、蒲家村、歌舞村、天井村，新建中一村、钟山村、城下村、大市村、子胥村、歌舞村。
2004年，撤销莪山畲族乡山阴岭村、山阴湾村、西金坞村、铁砧石村、戴丰村、双华村、尧山坞村、沈家村、衣冠村、中门村、潘龙村，新建莪山民族村、新丰民族村、龙峰民族村、沈冠村、中门民族村。
2004年，撤销新合乡高明村、高枧村、何家村、坑口村、雅坊村，新建新民村、新合村。
2004年底，桐庐县辖2个街道、7个镇、4个乡：桐君、旧县2个街道；富春江、横村、分水、江南、瑶琳、凤川、百江7个镇；钟山、合村、新合3个乡；以及莪山畲族乡。共有7个社区、14个居民区、188个行政村。
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