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001 云霄飞车杀人�6�1件事�6�9
054 游戏公司杀人�6�1件事�6�9
118 浪花连续杀人�6�1件事�6�9
128 黑衣组织10亿元抢劫�6�1件事�6�9
129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人�6�1件事�6�9★
176 与黑衣组织的再会（灰原篇）
177 与黑衣组织的再会（柯南篇）
178 与黑衣组织的再会（解决篇）
230 谜一样的乘客（前篇）
231 谜一样的乘客（后篇）
253 本厅刑事恋爱物语4（前篇）
254 本厅刑事恋爱物语4（后篇）
2�6�198�6�9 迷途森林中的光彦（前篇）
290 迷途森林中的光彦（后篇）
307 遗留下的无声的证词（前篇）
308 遗留下的无声的证词（后篇）
309 与黑衣组织的接触（交涉篇）
310 与黑衣组织的接触（追踪篇）
311 与黑衣组织的接触（决死篇）
338 4辆保时捷（前篇）
339 4辆保时捷（后篇）
340 洗手间里隐藏的秘密（前篇）
341 洗手间里隐藏的秘密（后篇）
345 与黑衣组织直面对决 满月之夜的二元推理★
425 黑暗冲击！组织魔爪伸来的瞬间★
462 黑衣组织的影子 年幼的目击者
463 黑衣组织的影子 奇妙的照明
4�6�146�6�9 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑衣组织的影子 珍珠的流星
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 扰乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
剧场版：
M5 通往天国的倒计时
M13 漆黑的追逐者
真人版：
SP2 工藤新一的复活 与黑衣组织的对决
漫画：24卷初登场 35卷（扮成银发杀人魔） 42卷有重头戏 49卷 53卷 58卷 59卷（这卷里只有一个镜头）
35卷中以莎朗.温亚德身份出现
26卷 29卷 32~33卷 41卷中的新出医生都是苦艾酒假扮
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