机关事业单位和事业单位的区别主要在于在职人员编制，机关事业单位多属于政府职能部门，其正式编制人员多为公务员，由国家政府统一拨发财政支出，而事业单位包括机关，但如下条所示，其除了机关的事业单位，最多是享受公务员待遇而已；
事业单位，实际上按照人员工资供给形式分类可分为三类，一类是全额供给，就是人员工资和办公经费全部由同级财政支付，如学校等。二类是差额供给，也就是单位有收费项目，但是较少，不够办公费用和人员工资，这样超出的部分由同级财政部门支付，如医院等。三类是自筹，也就是说单位有自己的收费项目或盈利项目，工资自给自足。在第三类人员里面按照管理方式可分为依照公务员管理和事业管理。
一般来讲机关和第三类里面依照公务员管理的单位称为“机关事业单位”，其中“机关”指政府职能部门。
所以显而易见，机关事业单位为政府职能部门各级单位，其正式编制人员多享受公务员待遇。