作为下游产物的生物工程专业，就业比生命科学、生物技术等基础理论和技术学科的大学毕业生要好。但就中国生物产业发展现状来看，中国的生物产业比起美国等发达国家而言处于起步阶段，老百姓对这个学科的了解和接受程度偏低，生物技术工厂就业岗位偏少。个别专业对口的的本科生（例如江南大学食品专业与无锡食品厂合作，本科生直接进工厂实习，工厂直接预订优秀毕业生；石油大学的个别生物化工专业毕业生直接进油田机关单位）。有些生物专业的大学生转行作销售，大部分还是选择考研深造，以期在研究生期间得到提升，毕业可以有更好就业前景。但总体而言，生物工程专业是深造越高，就业前景越好。
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