1、时间跨度不同
魏晋：公元220年—420年。
南北朝：公元420年—589年。
六朝：公元222年–589年。
2、朝代不同
魏晋：魏晋中“魏”指的是三国北方政权曹魏，而“晋”指的是司马氏建立的晋朝。
南北朝：南朝（420年—589年）有刘宋、南齐、南梁、南陈四朝。北朝（439年—581年）则包含北魏、东魏、西魏、北齐和北周五朝。
六朝：即孙吴（或称东吴、三国吴）、东晋、南朝宋（或称刘宋）、南朝齐（或称萧齐）、南朝梁、南朝陈这六个朝代。六朝京师均是南京（孙吴时期名为建业，西晋司马邺称帝后为避讳，改名建康）。
3、时代特征不同
魏晋：
魏晋是中国历史上政权更迭频繁的时期。由于长期的封建割据和连绵不断的战争，使这一时期中国文化的发展受到特别的影响。其突出表现则是玄学的兴起、佛教的输入、道教的勃兴及波斯、希腊文化的羼入。这一时期儒学的发展及孔子的形象和历史地位等问题也趋于复杂化。
南北朝：
出现民族大融合的趋势，比如北魏孝文帝改革，进一步加速少数民族封建化（汉化）的步伐。
六朝：
北方政权林立、战乱频仍的时候，江南地区因远离战场而比较安定，北方人口大量南迁使南方经济在六朝时期得到发展。
参考资料来源：百度百科-魏晋
参考资料来源：百度百科-南北朝
参考资料来源：百度百科-六朝
一、朝代不同
1、魏晋：指东汉瓦解后，三国到两晋的时期，通常所说的魏晋南北朝时期是这段历史的前一阶段。
2、南北朝：是南朝和北朝的统称。
3、六朝：一般是指中国历史上三国至隋朝的南方的六个朝代。
二、时间不同
1、魏晋：220年~420年。
2、南北朝：420年～589年。
3、六朝：222年~589年。
三、特点不同
1、魏晋：魏晋时期，国家政权更替频繁，思想自由开放。文化上得到了巨大的发展，文学、思想、美术、书法、音乐都诞生了影响后世的大家。人们对人物的品评由道德风范转向人物外貌，进而发展到人物的精神气质，文化史上称之为魏晋风流或魏晋风度。
2、南北朝：南北朝前期仍是世族政治，社会阶层分为世族、齐民编户、依附户及奴婢，对外交流也很兴旺，东到日本和朝鲜半岛，西到西域、中亚、西亚，南到东南亚与南亚。此时也出现民族大融合的趋势，比如北魏孝文帝改革，进一步加速少数民族汉化的步伐，在北魏孝文帝以后，北朝官制模仿南朝，并沿至唐代。
3、六朝：六朝承汉启唐，创造了极其辉煌灿烂的“六朝文明”，在科技、文学、艺术等诸方面均达到了空前的繁荣，中国南方得到巨大发展，开创了中华文明新的历史纪元。
本回答被网友采纳魏晋——魏就是三国时期，三国中以曹魏为正统，而且晋是司马氏在推翻曹魏的基础上建立的，一脉相承故称魏晋。
南北朝——晋短暂统一之后的分裂时期。北方兴起五胡十六国为北朝；南方兴起宋、齐、梁、陈四朝合称南朝。
六朝——三国吴、东晋、宋、齐、梁、陈都建都于建康（南京）合称六朝。和魏晋南北朝时间是重合的，只不过单说南方。本回答被提问者采纳
南朝，指东晋灭亡后，南方的宋齐梁陈四个朝代。
北朝，指北魏、西魏、东魏、北周、北齐。
六朝有两种说法。一是指东吴、东晋、宋齐梁陈等六个建都于建康（南京）的朝代。一是指曹魏、晋、宋齐梁陈六个有继承关系的朝代。
魏晋南北朝 只要指历史时间
当魏晋南北朝指国家时范围比六朝要大。
六朝：
1）三国吴、东晋、南朝宋、齐、梁、陈都建都于建康「今南京（ 宁 ）」史称南朝六朝，简称六朝，也作六代
2）三国魏、西晋、北魏、北齐、北周、隋，都建都于北方，史称北朝六朝，也简称六朝。