中国人民武装警察部队北京市总队医院在2001年至2006年连续六年被评为"医保先进单位"并获得三等奖，2005年被北京市评为"总量控制、结构调整"先进单位，医院计划生育手术和输血管理也先后多年被评为北京市先进单位，连续八年被评为"首都文明建设先进单位"，先后被北京市评为"双拥共建先进单位"、"首都绿化美化花园式单位"、"爱婴医院"，2007年被批准为"对口支援社区医疗双向转诊"定点单位，是"武警部队创伤急救技术中心"、‘’武警部队中医肾病诊疗中心“、"武警部队周围血管病治疗中心"、"武警医学院教学医院"、"北京中医学院教学基地"，在社会中享有良好声誉。其中医肾病科、中医口腔科 、中医甲状腺科 为特色科室。
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