农业银行总行于2004年起对借记卡收取年费，10元/年。对年对月系统自动扣收，如有欠费，系统将自动补扣。借记卡未启用状态下，不计收年费。
借记卡年费为系统自动扣收（月初），如月底开卡，则在下月初便自动扣除年费，且年费不予退还。
个人客户在农行仅有一个唯一账户（不含信用卡、贵宾账户），我行自2017年8月1日起，主动减免该账户的年费和小额账户管理费。如您在我行开立的银行账户中（不含信用卡）没有享受免收账户管理费（含小额账户管理费）和年费的，持卡人需持身份证件主动前往我行任一网点办理免费账户申请手续，为您提供一个免收账户管理费（含小额账户管理费）和年费的账户（不含信用卡、贵宾账户）。
已有代发工资、养老金账户符合双免条件的，不再为客户办理新的双免账户。已办理个人账户双免的，在办理代发工资、养老金账户时，仍按照我行及发改委相关规定，为此类账户进行费用减免。