克罗恩病和肠结核的鉴别比较重要，因为两者治疗方案不同，如果是克罗恩病，活动期需要激素冲击治疗，但是如果误诊，把肠结核当克罗恩病治疗，将加重疾病，故两病需要进行鉴别。鉴别可以从一下几个方面进行：1、临床表现上：克罗恩病常有肠外表现，比如口腔溃疡、虹膜睫状体炎、关节的红肿热痛、强直性脊柱炎等，肠结核则少有上述场外表现；2、病史上：肠结核患者常有其他部位的结核病史，如肺结核，胸片检查可见陈旧性肺结核病灶；3、实验室检查：肠结核患者结核菌索实验常阳性；4、肠镜检查：克罗恩病呈现节段性分布，见纵行溃疡，溃疡周围粘膜正常或呈鹅卵石样，肠腔狭窄，炎性息肉，病变肠段间粘膜外观正常，肠结核则为病变肠段粘膜充血、水肿、溃疡形成（环行溃疡、溃疡边缘呈鼠咬状有一定特征性），大小形态各异的炎症息肉，肠腔狭窄；5、病理：克罗恩病病理活检示非干酪坏死性肉芽肿或大量淋巴细胞聚集，肠结核病理示干酪坏死性肉芽肿或结核菌；6、试验性治疗；如上述方法能不能明确可试验性抗结核治疗。如果确诊为克罗恩病，治疗则如下：一：一般治疗：给予高营养低渣饮食，适当给予叶酸、维生素B12等多种维生素以及微量元素；二：药物治疗：1、5-氨基水杨酸，对于轻、中型患者有一定疗效，但对于重度患者疗效不佳；2、糖皮质激素，静脉使用激素可以用于重度或者活动期患者的治疗；3、免疫抑制剂，常用的有硫唑嘌呤和6-巯基嘌呤，起效较慢，起初应和激素共用，然后逐渐减少激素剂量；4、某些抗菌药物，如甲硝唑和喹诺酮类药物治疗肛周瘘；三：手术治疗：手术复发率较高，故手术适应症主要是针对并发症，包括肠梗阻、瘘管与脓肿形成、急性穿孔或不能控制的大量出血。
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