西医是在明末清初传入中国的。
明末清初的时候，来到中国的一些传教士在把基督教带到中国的同时，也把西方近代科学和医药学一起带到了中国。
由于当时主要传人的只是很浅薄的一些生理解剖只是，而且西方医学在当时的临床治疗技术方便并没有领先于中医，所以对中国的影响不是很大。
西方医学真正开始影响中医发展是在十九世纪初期，当时牛痘接种的方法和西医外科还是对眼科治疗技术的传入，随着西医的传入不断扩大，从而为西方医学在中国的发展奠定了基础。
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1693年夏季的一天，酷热难耐。京城百姓挥汗如雨，而紫禁城里的康熙正有气无力地躺在龙床上，身上盖着两层厚厚的棉被。就是这样，康熙还不停打着冷战。他脸色刷白，嘴唇发紫，眼窝凹陷，时而浑身抽搐，时而全身抖动。
白天盖棉被，晚上突然又高烧流汗，全身滚烫，汗如雨下的康熙犹如从水里捞出来一样。这一天，康熙忽冷忽热，一会儿下冰窖，一会儿上烤炉，就像冰火两重天。一代伟大君主正被肆虐的病魔折磨得死去活来，生不如死。
皇上得了怪病，宫中乱作一团，甚至还伴随着某种恐惧。虽然重病在身，仍然没有忘记国家大事。他下旨朕因违和，于国家政事久未办理，奏章照常送进，令皇太子办理，付批办处批发。想来康熙一是怕引起国家上下恐慌，不利稳定。
二来可能也是对外显示一种战胜病魔的信心和态度。当时的中国百姓与御医对中医都很自信，果然，有人在一本中医名著《金匮要略》中找到了方子。此为验方，需将蜀漆、疟母、鳖甲、柴胡、桂枝等多味中药制成鳖甲煎丸。
药丸很快做好，但还不能给皇上吃，所以必须先拿别人做实验。找来一个同样病症的人，让其吃了药丸，以观察效果，结果不管事。御医又反复调整，连青蒿也用上了，仍然没有效果，御医们都泄气了，康熙那边连气带病也快咽气了。
就在这个时候有俩洋和尚求见。洋和尚献上一种西药，说这是一种神奇的药物，对此病有奇效。二人正是法国传教士白晋、张诚，因为受好客中国的感染，慕名来中国传教。因为法国人也曾有人常患此病，便携带备用。
此药正是奎宁，也叫金鸡纳霜。当时朝廷内外对西洋玩意根本不相信，什么金鸡、银鸡的，还纳霜，等着纳鞋底子吧。康熙也不相信，但中医已经没有任何办法。康熙便下旨，尽快找人实验，死马当活马医。
御医们此时怎么拦也拦不住了，只好硬着头皮让病人吃西药。说来也巧，广东的传教士正好收到法国快递来的金鸡纳霜，整整500克，立刻火速送到北京实验。结果，奄奄一息的病人，吃药后第二天便转危为安。
三个病人，一个发作前服药、一个发作中服药、一个发作后服药，均先后痊愈。就连四个大臣都果断吃了，也没有任何副作用。饱受疟疾折磨的康熙服药后，身体很快好转，只三五天便痊愈。
康熙大喜，不但传教士允许在北京传教，还奖励给传教士们一座大豪宅。同时，责令刑部对几位昏庸的御医进行严惩。
参考资料来源：百度百科—西医（传入中国）