第1个回答 2013-07-29
1 云霄飞车杀人事件54 电玩公司杀人事件
128 黑衣组织十亿元抢劫事件
129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件
176 与黑衣组织的再会（灰原篇）
177 与黑衣组织的再会（柯南篇）
178 与黑衣组织的再会（解决篇）
230 神秘的乘客（前篇）
231 神秘的乘客（后篇）
271 隐藏匆忙中的省略（前篇）
272 隐藏匆忙中的省略（后篇）
286 工藤新一NY事件（事件篇）
288 工藤新一NY事件（解决篇）
289 光彦森林迷失记（前篇）*
290 光彦森林迷失记（后篇）*
307 遗留的无声证言（前篇）
308 遗留的无声证言（后篇）
309 与黑衣组织的接触（交涉篇）
310 与黑衣组织的接触（追迹篇）
311 与黑衣组织的接触（决死篇）
338 四台保时捷（前篇）
339 四台保时捷（后篇）
340 厕所里隐藏的秘密（前篇）
341 厕所里隐藏的秘密（后篇）
345 与黑衣组织的直面对决 满月之夜的二元推理
425 黑色冲击！黑衣组织的魔爪伸来的瞬间
462 黑衣组织的影子 年幼的目击者
463 黑衣组织的影子 奇妙的照明
464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑衣组织的影子 珍珠的流星
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 搅乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
563 侦探团VS劫匪团 骚动
564 侦探团VS劫匪团 沉默
578 召唤危机的红色前兆
579 黑色与13的暗示
580 逼近的黑之时限
581 摇曳的红色目标
667 婚礼前夜（前篇）*
668 婚礼前夜（后篇）*
671 侦探们的夜想曲（案件）*
672 侦探们的夜想曲（绑架）*
673 侦探们的夜想曲（推理）*
674 侦探们的夜想曲（波本）
681 以性命为赌注的恋爱转播（转播开始）*
683 以性命为赌注的恋爱转播（现场突入）*
699 逼近灰原秘密的黑影（前篇）*
700 逼近灰原秘密的黑影（后篇）
701 漆黑的特快列车（发车）
702 漆黑的特快列车（隧道）
703 漆黑的特快列车（交叉）（2013年7月27日播出）
704 漆黑的特快列车（终点）（2013年8月3日播出）
705 密室中的柯南 *（2013年8月10日播出）
706 在波本面前解谜 （2013年8月17日播出）
剧场版：
M 5 通往天国的倒计时（2001年）
M 13 漆黑的追踪者（2009年）
第2个回答 2013-07-29
681 以性命为赌注的恋爱转播（转播开始）
682 以性命为赌注的恋爱转播（走投无路）
683 以性命为赌注的恋爱转播（现场突入）
684 泡沫、蒸汽和香烟（前篇）
685 泡沫、蒸汽和香烟（后篇）
686 装载了定时炸弹的汽车◆
687 无人能解的冰之陷阱◆
688 高木警官捡到3000万◆
689 来自委托人的信息◆
690 工藤优作未解决的事件（前篇）
691 工藤优作未解决的事件（后篇）
692 隅田川的夜樱风景线（前篇）◆
693 隅田川的夜樱风景线（后篇）◆
694 老字号中消失的点心◆（与M 17《绝海的侦探》的联动故事）
695 葡萄园里的玫瑰花◆
696 花坛破坏者的阴谋◆
697 女校的窗户◆
698 不会吧！UFO坠落事件◆
699 逼近灰原秘密的黑影（前篇）
700 逼近灰原秘密的黑影（后篇）B
701 漆黑的特快列车（发车）B
702 漆黑的特快列车（隧道）B
703 漆黑的特快列车（交叉）B
704 漆黑的特快列车（终点）B（2013年8月3日播出）
705 密室中的柯南 B（2013年8月10日播出）
706 在波本面前解谜 B（2013年8月17日播出）
707 被陷害的名侦探◆（2013年8月31日播出）
有B的都是黑衣组织登场的，714集是伪集数对应正集数703，最新的系列神秘列车：柯南一行人去坐神秘列车，贝姐联络琴酒准备和波本一起在这途中杀掉雪莉（灰原），柯南早有计划。贝姐扮成了伤疤赤井，703集时贝姐卸妆与有希子展开对决，最后在柯南的布局下，对决胜利！成功让组织以为雪莉真的死了。
第3个回答 2013-07-29
001 云霄飞车杀人事件
013 奇妙的寻人杀人事件
054 电玩公司杀人事件
128 黑衣组织十亿元抢劫事件
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件
176 与黑暗组织的再会（灰原篇）
177 与黑暗组织的再会（柯南篇）
178 与黑暗组织的再会（解决篇）
230 迷一样的乘客（前篇）
231 迷一样的乘客（后篇）
271 隐藏匆忙中的省略（前篇）
272 隐藏匆忙中的省略（后篇）
286 工藤新一纽约事件（事件篇）
287 工藤新一纽约事件（推理篇）
288 工藤新一纽约事件（解决篇）
307 没有声音的证词（前篇）
308 没有声音的证词（后篇）
309 与黑暗组织的接触（交涉篇）
310 与黑暗组织的接触（追迹篇）
311 与黑暗组织的接触（决死篇）
338 四台保时捷（前篇）
339 四台保时捷（后篇）
340 厕所隐藏的秘密（前篇）
341 厕所隐藏的秘密（后篇）
345 与黑暗组织的直面对决 满月之夜的二元推理
425 黑色的冲击！黑衣组织的魔爪伸来的瞬间
462 黑暗组织的影子 年幼的目击者
463 黑暗组织的影子 奇妙的照明
464 黑暗组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑暗组织的影子 珍珠的流星
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 搅乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
509 红白黄色与侦探团
510 柯南VS双重暗号之谜
511 推理对决！新一VS冲矢昴
542 鱼儿消失的一角岩（前篇）
543 鱼儿消失的一角岩（后篇）
563 侦探团VS劫匪团 骚动
564 侦探团VS劫匪团 沉默
578 召唤危机的红色前兆
579 黑色13的暗示
580 逼近的黑之时限
581 摇曳的红色目标
622 紧急事态252（前篇）
623 紧急事态252（后篇）
剧场版：通往天国的倒计时（5）、漆黑的追踪者（13）
第4个回答 2013-07-29
最近更新的就跟主线有关啊，你看最近几集吧，漫画更新的快些，可以到贴吧看看，保证你可以看到各种有关黑衣的蛛丝马迹
第5个回答 2013-07-29
1 云霄飞车杀人事件 B/S
54 电玩公司杀人事件 B
128 黑衣组织10亿元抢劫事件◆ B
29 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件★ B
176 与黑衣组织的再会（灰原篇） B
177 与黑衣组织的再会（柯南篇） B
178 与黑衣组织的再会（解决篇） B
230 神秘的乘客（前篇） B/F
231 神秘的乘客（后篇） B/F
272 情急之下的应变之道（后篇） B/F
274 幽灵屋的真相（前篇） B
286 工藤新一纽约事件（事件篇） B/S
287 工藤新一纽约事件（推理篇） B/S
288 工藤新一纽约事件（解决篇） B/F/S
289 光彦森林迷失记（前篇） B
290 光彦森林迷失记（后篇） B
307 残留下来的无声证言（前篇） B
308 残留下来的无声证言（后篇） B/F
309 与黑衣组织的接触（交涉篇） B/F
310 与黑衣组织的接触（追踪篇） B
311 与黑衣组织的接触（决死篇） B/F
339 四辆保时捷（后篇） B/F
340 厕所里隐藏的秘密（前篇） B
341 厕所里隐藏的秘密（后篇） B
345 与黑衣组织直面对决 满月之夜的双重谜案★ B/F/X
425 黑色冲击！组织魔爪伸来的瞬间★ B/F/C
462 黑衣组织的影子 小小的目击者 B/F/C
464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬 B
465 黑衣组织的影子 珍珠流星 B
484 黑色照片的去向（前篇） B/X
485 黑色照片的去向（后篇） B/C
491 红与黑的碰撞 开端 B/F/C/X
492 红与黑的碰撞 血缘 B/F/C
493 红与黑的碰撞 绝叫 B/F/C
494 红与黑的碰撞 冥土 B/F/C
495 红与黑的碰撞 昏睡 B/F/C
496 红与黑的碰撞 侵入 B/F/C
497 红与黑的碰撞 觉醒 B/F/C
498 红与黑的碰撞 搅乱 B/F/C
499 红与黑的碰撞 伪装 B/F/C
500 红与黑的碰撞 遗言 B/F/C
501 红与黑的碰撞 嫌疑 B/F/C
502 红与黑的碰撞 洁白 B/F/C
503 红与黑的碰撞 决死 B/F/C
504 红与黑的碰撞 殉职 B/F/C
579 黑与13的暗示 B/F/C
580 逼近的黑色时刻 B/F/C
581 红色的摇摆目标 B/F/C
674 侦探们的夜想曲（波本）B
700 逼近灰原秘密的黑影（后篇）B
701 漆黑的特快列车（发车）B
702 漆黑的特快列车（隧道）B
703 漆黑的特快列车（交叉）B
704 漆黑的特快列车（终点）B（2013年8月3日播出）
705 密室中的柯南 B（2013年8月10日播出）
706 在波本面前解谜 B（2013年8月17日播出）
绝对完整，我一个一个找的。
B：有黑衣组织出场
F：有FBI出场
C：有CIA出场
S：有新一出场
X：有服部出场